RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460909.1

RPUSD3-210, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-210ENST00000460909 CYP4A11Q02928 519 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 IL17AQ16552 155 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 RASIP1Q5U651 963 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 DEFB128Q7Z7B8 93 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23.12■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.11■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa23.11■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 PRPHP41219 470 aa23.11■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 MGAT3Q09327 533 aa23.11■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa23.11■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 LINC01465Q8N7H1 131 aa23.11■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 IGSF22Q8N9C0 903 aa23.11■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.11■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 NEK9Q8TD19 979 aa23.11■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 LYPLA2O95372 231 aa23.1■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 FGBP02675 491 aa23.1■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 PDIA5Q14554 519 aa23.1■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 RSPH3Q86UC2 560 aa23.1■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 TPH2Q8IWU9 490 aa23.1■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 HERVK_113Q902F9 699 aa23.1■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 SH2D3AQ9BRG2 576 aa23.1■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 ZBTB39O15060 712 aa23.09■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 MAGEB2O15479 319 aa23.09■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 YWHABP31946 246 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 LRIT3Q3SXY7 679 aa23.09■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 MTERF2Q49AM1 385 aa23.09■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 PLA2G4FQ68DD2 849 aa23.09■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 FAM173BQ6P4H8 233 aa23.09■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23.09■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 NME8Q8N427 588 aa23.09■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 ARID2Q68CP9 1835 aa23.08■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa23.08■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 MED24O75448 989 aa23.08■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 NPEPPSP55786 919 aa23.08■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 TMEM266Q2M3C6 531 aa23.08■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 TCTN1Q2MV58 587 aa23.08■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 OTOP2Q7RTS6 562 aa23.08■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 CYP26B1Q9NR63 512 aa23.08■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
RPUSD3-210ENST00000460909 MAFO75444 373 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 RPA1P27694 616 aa23.07■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa23.07■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 TMEM62Q0P6H9 643 aa23.07■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa23.07■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 EFCAB12Q6NXP0 572 aa23.07■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 DTHD1Q6ZMT9 781 aa23.07■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 LRRC71Q8N4P6 559 aa23.07■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 METTL13Q8N6R0 699 aa23.07■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 TUFT1Q9NNX1 390 aa23.07■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 LRWD1Q9UFC0 647 aa23.07■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 CDY2AQ9Y6F7 541 aa23.07■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa23.07■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 CLCN3P51790 818 aa23.06■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 IER5Q5VY09 327 aa23.06■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 PPME1Q9Y570 386 aa23.06■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 SZT2Q5T011 3432 aa23.06■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa23.06■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 DRP2Q13474 957 aa23.05■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 PKP1Q13835 747 aa23.05■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 LPIN1Q14693 890 aa23.05■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 FBXO47Q5MNV8 452 aa23.05■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.05■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 OTUD6AQ7L8S5 288 aa23.05■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 CEP170P1Q96L14 293 aa23.05■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 ANKEF1Q9NU02 776 aa23.05■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 TRPV2Q9Y5S1 764 aa23.05■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 CLIC4Q9Y696 253 aa23.05■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 MYH15Q9Y2K3 1946 aa23.05■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 A0A087WWV3 80 aa23.04■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 PP2D1A8MPX8 630 aa23.04■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 GPR32O75388 356 aa23.04■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 BMP15O95972 392 aa23.04■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 VTNP04004 478 aa23.04■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 PTPAQ15257 358 aa23.04■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 ECM1Q16610 540 aa23.04■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 DBF4BQ8NFT6 615 aa23.04■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 ERMNQ8TAM6 284 aa23.04■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 PIGOQ8TEQ8 1089 aa23.04■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 RAB34Q9BZG1 259 aa23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms