RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444685.1

CBX1-204, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CBX1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-204ENST00000444685 NEK1Q96PY6 1258 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-204ENST00000444685 TAAR1Q96RJ0 339 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-204ENST00000444685 DDX19BQ9UMR2 479 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-204ENST00000444685 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
CBX1-204ENST00000444685 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
CBX1-204ENST00000444685 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-204ENST00000444685 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
CBX1-204ENST00000444685 ABCB11O95342 1321 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-204ENST00000444685 WDR19Q8NEZ3 1342 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-204ENST00000444685 MICAL3Q7RTP6 2002 aa5.96□□□□□ -1.45
CBX1-204ENST00000444685 PRR23AA6NEV1 266 aa5.96□□□□□ -1.46
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CBX1-204ENST00000444685 CCNYL3P0C7X3 344 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa5.96□□□□□ -1.46
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CBX1-204ENST00000444685 MTMR3Q13615 1198 aa5.96□□□□□ -1.46
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CBX1-204ENST00000444685 ASCL5Q7RTU5 278 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 TMEM87AQ8NBN3 555 aa5.96□□□□□ -1.46
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CBX1-204ENST00000444685 PRDM9Q9NQV7 894 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 CLEC1BQ9P126 229 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 LRFN2Q9ULH4 789 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 TANC1Q9C0D5 1861 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa5.96□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 M0QZ92 97 aa5.95□□□□□ -1.46
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CBX1-204ENST00000444685 ORC4O43929 436 aa5.95□□□□□ -1.46
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CBX1-204ENST00000444685 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 PER2O15055 1255 aa5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 DGKIO75912 1065 aa5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 ITGB1P05556 798 aa5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 GHRP10912 638 aa5.94□□□□□ -1.46
CBX1-204ENST00000444685 PCP11498 1178 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
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