RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417895.1

NEK7-204, Transcript of NIMA related kinase 7, human

TSL 3

Gene NEK7, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK7-204	ENST00000417895	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	ZNF839	A8K0R7	811 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895		H0Y858	1186 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	MUSK	O15146	869 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	SOD2	P04179	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	GLRB	P48167	497 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	USP51	Q70EK9	711 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	KCTD1	Q719H9	257 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	PALM2	Q8IXS6	379 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	VPS11	Q9H270	941 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	SUV39H1	O43463	412 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	IL18BP	O95998	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	AMH	P03971	560 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	HMGA2	P52926	109 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	LMF1	Q96S06	567 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	DISP1	Q96F81	1524 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEK7-204	ENST00000417895	ACOT7	O00154	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	RAB33A	Q14088	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	GNRHR2	Q96P88	292 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	IPPK	Q9H8X2	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	PTPRG	P23470	1445 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	BLACE	A4D250	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	FOXS1	O43638	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	CUTA	O60888	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	SLPI	P03973	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	POLD1	P28340	1107 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	MRI	Q9BWK5	157 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	NUP155	O75694	1391 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	ASXL2	Q76L83	1435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	UNC13B	O14795	1591 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	WNT9A	O14904	365 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	PAK1	Q13153	545 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	CD244	Q9BZW8	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	NUP160	Q12769	1436 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	AQP7	O14520	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	PLIN1	O60240	522 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	RAC3	P60763	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	GPR19	Q15760	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NEK7-204	ENST00000417895	EDA	Q92838	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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