RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 NFRKBQ6P4R8 1299 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D5Q92609 795 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 HSD17B14Q9BPX1 270 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 SELENOOQ9BVL4 669 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 EHMT1Q9H9B1 1298 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 KCND2Q9NZV8 630 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 SEL1LQ9UBV2 794 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 TBCAO75347 108 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 ZNF76P36508 570 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 CASP5P51878 434 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 PPP2R5CQ13362 524 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 USH1GQ495M9 461 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 EMBQ6PCB8 327 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 CRACR2AQ9BSW2 395 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 ZHX3Q9H4I2 956 aa26.06■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 MYH10P35580 1976 aa26.05■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 TCP10L2B9ZVM9 353 aa26.05■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 SYF2O95926 243 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 EPB41P11171 864 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 STAT2P52630 851 aa26.05■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 NNTQ13423 1086 aa26.05■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 EXOC3L4Q17RC7 722 aa26.05■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 MEI1Q5TIA1 1274 aa26.05■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa26.05■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 TMX2Q9Y320 296 aa26.05■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 GFPT2O94808 682 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 ACTN2P35609 894 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 LRRC1Q9BTT6 524 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 MKNK1Q9BUB5 465 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 VEZTQ9HBM0 779 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 STIM2Q9P246 746 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 A0A087X0T9 212 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 NR3C1P04150 777 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 FAM228BP0C875 321 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 UCHL3P15374 230 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 EPHB4P54760 987 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 DLK2Q6UY11 383 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 GBP6Q6ZN66 633 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 SLC5A5Q92911 643 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 BHMT2Q9H2M3 363 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 GOPCQ9HD26 462 aa26.04■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 A0A1W2PRG0 241 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 PSMD10O75832 226 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 ERCC3P19447 782 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 PON1P27169 355 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 LMAN1P49257 510 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 EPHA7Q15375 998 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 RINT1Q6NUQ1 792 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 OTOP1Q7RTM1 612 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 FMNL3Q8IVF7 1028 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 CHURC1Q8WUH1 139 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 CAVIN3Q969G5 261 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 DRC1Q96MC2 740 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 CSRNP1Q96S65 589 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 DEFB129Q9H1M3 183 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 GGA3Q9NZ52 723 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 PGAP2Q9UHJ9 254 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 INTUQ9ULD6 942 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 ASTN1O14525 1302 aa26.03■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 MEIS1O00470 390 aa26.02■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 KIAA0753Q2KHM9 967 aa26.02■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa26.02■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 FAM133AQ8N9E0 248 aa26.02■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 TMOD2Q9NZR1 351 aa26.02■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.02■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 RNF40O75150 1001 aa26.02■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 PALMO75781 387 aa26.02■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 MYBP10242 640 aa26.02■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 KLRC1P26715 233 aa26.02■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 JAG1P78504 1218 aa26.02■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 ZSCAN26Q16670 478 aa26.02■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa26.02■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa26.02■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 SPAG5Q96R06 1193 aa26.02■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PMS1-205ENST00000409985 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 BUB1O43683 1085 aa26.01■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 AKAP3O75969 853 aa26.01■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 IVLP07476 585 aa26.01■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 POLR2MP0CAP2 368 aa26.01■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 MYBL2P10244 700 aa26.01■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 GYS2P54840 703 aa26.01■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 C1orf186Q6ZWK4 172 aa26.01■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 SLC35C1Q96A29 364 aa26.01■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 BORCS6Q96GS4 357 aa26.01■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 RUSC1Q9BVN2 902 aa26.01■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 WDR11Q9BZH6 1224 aa26.01■■□□□ 1.75
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