RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 CTSHP09668 335 aa25.02■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 TECP42680 631 aa25.02■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 C4orf19Q8IY42 314 aa25.02■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 SH2D3AQ9BRG2 576 aa25.02■■□□□ 1.6
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB39O15060 712 aa25.01■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 PFKMP08237 780 aa25.01■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 CYP4A11Q02928 519 aa25.01■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 RESTQ13127 1097 aa25.01■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 LXNQ9BS40 222 aa25.01■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 DDX11L8A8MPP1 907 aa25■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa25■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP25■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP25■■□□□ 1.596e-6■■■■□ 25.8
SYF2-201ENST00000236273 OTOP2Q7RTS6 562 aa25■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 BRAPQ7Z569 592 aa25■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 CEP131Q9UPN4 1083 aa25■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa24.99■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 STX6O43752 255 aa24.99■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 LYPLA2O95372 231 aa24.99■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa24.99■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 MAGEB2O15479 319 aa24.98■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 NPEPPSP55786 919 aa24.98■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 MTERF2Q49AM1 385 aa24.98■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 PLA2G4FQ68DD2 849 aa24.98■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 TPH2Q8IWU9 490 aa24.98■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 NME8Q8N427 588 aa24.98■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 CDY2AQ9Y6F7 541 aa24.98■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 LAD1O00515 517 aa24.97■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 MED24O75448 989 aa24.97■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 PRPHP41219 470 aa24.97■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 TMEM62Q0P6H9 643 aa24.97■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 PDIA5Q14554 519 aa24.97■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa24.97■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 EFCAB12Q6NXP0 572 aa24.97■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 FAM173BQ6P4H8 233 aa24.97■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 RSPH3Q86UC2 560 aa24.97■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 CATSPER3Q86XQ3 398 aa24.97■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 IGSF22Q8N9C0 903 aa24.97■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa24.97■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP24.97■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 CDHR5Q9HBB8 845 aa24.97■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa24.96■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 YWHABP31946 246 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 CLCN3P51790 818 aa24.96■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 DRP2Q13474 957 aa24.96■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 LRRC71Q8N4P6 559 aa24.96■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 DBF4BQ8NFT6 615 aa24.96■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 NEK9Q8TD19 979 aa24.96■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 LRCH3Q96II8 777 aa24.96■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 CYP26B1Q9NR63 512 aa24.96■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa24.95■■□□□ 1.59
SYF2-201ENST00000236273 A0A087WWV3 80 aa24.95■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 MAFO75444 373 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 LPIN1Q14693 890 aa24.95■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 ECM1Q16610 540 aa24.95■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 FBXO47Q5MNV8 452 aa24.95■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 CNKSR3Q6P9H4 555 aa24.95■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 METTL13Q8N6R0 699 aa24.95■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 GPR32O75388 356 aa24.94■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa24.94■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 IER5Q5VY09 327 aa24.94■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 TUFT1Q9NNX1 390 aa24.94■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 TRPV2Q9Y5S1 764 aa24.94■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 VTNP04004 478 aa24.93■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 GHRP10912 638 aa24.93■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 RPA1P27694 616 aa24.93■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 CEP170P1Q96L14 293 aa24.93■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 SUGCTQ9HAC7 445 aa24.93■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 LRWD1Q9UFC0 647 aa24.93■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 PTPRSQ13332 1948 aa24.93■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 PP2D1A8MPX8 630 aa24.92■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 GRXCR1A8MXD5 290 aa24.92■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 PKP1Q13835 747 aa24.92■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 PTPAQ15257 358 aa24.92■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 TMEM266Q2M3C6 531 aa24.92■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 DTHD1Q6ZMT9 781 aa24.92■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 PIGOQ8TEQ8 1089 aa24.92■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 TMEM40Q8WWA1 233 aa24.92■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 ADAMTS10Q9H324 1103 aa24.92■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 CLIC4Q9Y696 253 aa24.92■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 SQORQ9Y6N5 450 aa24.92■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 ARID2Q68CP9 1835 aa24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.2 ms