RNA–Protein interactions for RNA: YPR137W

RRP9, Transcript of Protein involved in pre-rRNA processing, yeast

Gene RRP9, Length 1,722 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP9	YPR137W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RRP9	YPR137W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RRP9	YPR137W	SPS100	P13130	326 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RRP9	YPR137W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RRP9	YPR137W	RAD51	P25454	400 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RRP9	YPR137W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RRP9	YPR137W	YOR062C	P36025	268 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RRP9	YPR137W	YMR262W	P38430	313 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RRP9	YPR137W	YHR177W	P38867	453 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RRP9	YPR137W	FAD1	P38913	306 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RRP9	YPR137W	REE1	P40893	198 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RRP9	YPR137W	PRY1	P47032	299 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RRP9	YPR137W	SDC1	Q03323	175 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RRP9	YPR137W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RRP9	YPR137W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RRP9	YPR137W	FAR10	Q06001	478 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RRP9	YPR137W	HDA2	Q06629	674 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RRP9	YPR137W	COS7	Q07788	383 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RRP9	YPR137W	SGT1	Q08446	395 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RRP9	YPR137W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	REC107	P21651	314 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	CTR86	P25355	563 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	DMC1	P25453	334 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	YCL049C	P25577	312 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	NGG1	P32494	702 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	NUP2	P32499	720 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	YEF1	P32622	495 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	YKR073C	P36153	106 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	ARN1	P38731	627 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	VPS41	P38959	992 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	GAB1	P41733	394 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	ECL1	P48235	211 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	MRM2	P53123	320 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	YGR066C	P53242	292 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	YMR010W	Q03687	405 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	INP1	Q03694	420 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	YDR249C	Q03787	373 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	NFS1	P25374	497 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	NSG1	P38837	291 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	FAA2	P39518	744 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	YDR476C	Q03362	224 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	YOL131W	Q08270	108 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	ARG81	P05085	880 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	RAP1	P11938	827 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	KSS1	P14681	368 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	YPT7	P32939	208 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	EXO84	P38261	753 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	TDP1	P38319	544 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	MGE1	P38523	228 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	YER010C	P40011	234 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	ALG5	P40350	334 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	BUR2	Q05949	395 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	CBS1	P14066	229 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	CTA1	P15202	515 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	PHO91	P27514	894 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	TOD6	P34219	525 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	RSM22	P36056	628 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	MAL32	P38158	584 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	ATG14	P38270	344 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	YJL193W	P39542	402 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	ECM10	P39987	644 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	IMA1	P53051	589 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	YNR040W	P53736	256 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	NAT4	Q04751	285 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	SFH1	Q06168	426 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	5.75	□□□□□ -1.49	not detected
RRP9	YPR137W	SWM1	Q12379	170 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	MET2	P08465	486 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	PHO81	P17442	1178 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	YIM1	P28625	365 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	SMK1	P41808	388 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	ARR1	Q06596	294 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	RPN6	Q12377	434 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	NPP1	P25353	742 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	MRPL17	P36528	281 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	SEN34	P39707	275 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	QDR2	P40474	542 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	RAD30	Q04049	632 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	PDX1	P16451	410 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RRP9	YPR137W	SEC61	P32915	480 aa		5.73	□□□□□ -1.49

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