RNA–Protein interactions for RNA: YML039W

YML039W, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YML039W, Length 5,268 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML039WYML039W ANR2P36090 516 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data2.5□□□□□ -2.01not detected
YML039WYML039W RFT1P38206 574 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data2.5□□□□□ -2.01not detected
YML039WYML039W YPT35P38815 214 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W EGD2P38879 174 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W ECM10P39987 644 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W YIL108WP40483 696 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W SER33P40510 469 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W PKP1P40530 394 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W PFA3P42836 336 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W QRI7P43122 407 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W UBC13P52490 153 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W YGL101WP53144 215 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W MTL1P53214 551 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W CUS2P53830 285 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W URH1Q04179 340 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W SEC13Q04491 297 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W TRI1Q05024 226 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W BRX1Q08235 291 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W REP1P03871 373 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W TRX1P22217 103 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W VPS34P22543 875 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W RRP43P25359 394 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W YCR015CP25616 317 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W SYP1P25623 870 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W INO2P26798 304 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W GUT2P32191 649 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W ECM15P35195 104 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W RKM3P38222 552 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W NTC20P38302 140 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W MGE1P38523 228 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W SIC1P38634 284 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W ARP1P38696 384 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W YND1P40009 630 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W UTP7P40055 554 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W GET2P40056 285 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W COX16P47081 118 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W YJR012CP47087 207 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W EMC2P47133 292 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W KEL2P50090 882 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W SBH2P52871 88 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W RCF2P53721 224 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W YMR130WQ04223 302 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W KAR5Q04746 504 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W YMR254CQ04838 102 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W CRR1Q05790 422 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W ARR2Q06597 130 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W BTS1Q12051 335 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W MF(ALPHA)1P01149 165 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W RPL25P04456 142 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W HIP1P06775 603 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W RPS23BP0CX30 145 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W ADH4P10127 382 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W IDP1P21954 428 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W YCR101CP25607 182 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W YJU3P28321 313 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W GLC7P32598 312 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W KKQ8P36004 724 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W RRN3P36070 627 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W YBR220CP38318 560 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data2.5□□□□□ -2.01not detected
YML039WYML039W RPL13BP40212 199 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W DLS1P40366 167 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W TED1P40533 473 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W DIM1P41819 318 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W FIG4P42837 879 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W PET130P47065 347 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W MTQ1P53944 314 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W ERV25P54837 211 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W ROD1Q02805 837 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W YML119WQ03208 357 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W EFR3Q03653 782 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W TRS23Q03784 219 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W RIF2Q06208 395 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W UIP4Q08926 304 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W SAM4Q08985 325 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W TGS1Q12052 315 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W DAS2Q12084 232 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W PAR32Q12515 295 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W VPS33P20795 691 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W SEC65P29478 273 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W ERG1P32476 496 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W NGG1P32494 702 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W RPC34P32910 317 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W YFL052WP43551 465 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W PHO86P46956 311 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W ILM1P47155 203 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W MCM22P47167 239 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W NSA1P53136 463 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W SNF12P53628 566 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W YNL181WP53878 407 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W PFA5Q03289 374 aa2.5□□□□□ -2.01
YML039WYML039W BRE4Q07660 1125 aa2.5□□□□□ -2.01
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