RNA–Protein interactions for RNA: YLR233C

EST1, Transcript of TLC1 RNA-associated factor involved in telomere length regulation, yeast

Gene EST1, Length 2,100 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EST1	YLR233C	URH1	Q04179	340 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YDR115W	Q04598	105 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YLR177W	Q06251	628 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	ATG34	Q12292	412 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	SFM1	Q12314	213 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	SCEI	P03882	235 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	CUP2	P15315	225 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	CPT1	P17898	393 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RHB1	P25378	209 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	TOM20	P35180	183 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YBR056W	P38081	501 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	BDH1	P39714	382 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	IES5	P40060	125 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	PHO86	P46956	311 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	MRX6	P48564	524 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	SHE4	P51534	789 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	ROG1	P53118	685 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	MEP3	P53390	489 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	SED5	Q01590	340 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YPL113C	Q02961	396 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	MSC3	Q05812	728 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YDL211C	Q12121	372 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	NCA2	Q12374	616 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	COX10	P21592	462 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	CLB1	P24868	471 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	KRE2	P27809	442 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	PMT1	P33775	817 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	CST26	P38226	397 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	WSC4	P38739	605 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YEL057C	P39983	233 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	HEM14	P40012	539 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	HXT14	P42833	540 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	GMC1	Q04399	608 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	APC4	Q04601	652 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	GTO3	Q04806	366 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	SOR2	Q07786	357 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	ATG29	Q12092	213 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	HSP42	Q12329	375 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	TFC7	Q12415	435 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.07	□□□□□ -2.4	not detected
EST1	YLR233C	MET2	P08465	486 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	HOM3	P10869	527 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	UNG1	P12887	359 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	DAL81	P21657	970 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	LDS1	P31379	325 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YEL043W	P32618	956 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	ANP1	P32629	500 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	SPO23	P33757	523 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YBR241C	P38142	488 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	SHE1	P38200	338 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	MED6	P38782	295 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	POP2	P39008	433 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	DOT5	P40553	215 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YCH1	P42937	148 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YGR015C	P53208	328 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	PRM1	P53835	661 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	VPS75	P53853	264 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	MRX11	Q03079	207 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YML131W	Q03102	365 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	PEX30	Q06169	523 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YPR063C	Q12160	140 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	BUG1	Q12191	341 aa		0.07	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	STE2	D6VTK4	431 aa		0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	SEM1	O94742	89 aa		0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	IMA3	P0CW40	589 aa		0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	IMA4	P0CW41	589 aa		0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	TFS1	P14306	219 aa		0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	KRE1	P17260	313 aa		0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	BEM1	P29366	551 aa		0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YMR262W	P38430	313 aa		0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	GEP4	P38812	185 aa		0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RMD8	P43620	662 aa		0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	NAS6	P50086	228 aa		0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	0.06	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RNH201	P53942	307 aa		0.06	□□□□□ -2.4

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.7 ms