RNA–Protein interactions for RNA: YJR104C

SOD1, Transcript of Cytosolic copper-zinc superoxide dismutase, yeast

Gene SOD1, Length 465 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOD1	YJR104C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SCM4	P32564	187 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SRB6	P32570	121 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YBR284W	P38150	797 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ECM8	P38246	354 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PEX32	P38292	413 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ERV15	P38312	142 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	NSG1	P38837	291 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	CYC2	P38909	366 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	IPT1	P38954	527 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YJL206C	P39529	758 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MIT1	P40002	666 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	LTP1	P40347	161 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YIR035C	P40579	254 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YJL043W	P47053	257 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MOG1	P47123	218 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ABM1	P47146	123 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YML6	P51998	286 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YGL117W	P53133	265 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ERV14	P53173	138 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YNR068C	P53754	272 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	OCA2	P53949	197 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YCL001W-A	P87012	153 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.38	□□□□□ -1.87	not detected
SOD1	YJR104C	TIM44	Q01852	431 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ENA2	Q01896	1091 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MRPS16	Q02608	121 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	CWC27	Q02770	301 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	TDA1	Q03533	586 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	CSN9	Q03981	162 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PLM2	Q04383	521 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	HSP31	Q04432	237 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PRM6	Q04705	352 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MDM30	Q05930	598 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YLR224W	Q05947	369 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	GAS2	Q06135	555 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	REH1	Q06709	432 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MED1	Q12321	566 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ENA5	Q12691	1091 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SAS5	Q99314	248 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ARG81	P05085	880 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MET2	P08465	486 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	BAR1	P12630	587 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	GLN3	P18494	730 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MRPL44	P19956	98 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MAK31	P23059	88 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	UBC8	P28263	218 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YIM1	P28625	365 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	AEP1	P32493	518 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ECM25	P32525	599 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RML2	P32611	393 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	FRE1	P32791	686 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PDC2	P32896	925 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	VPS17	P32913	551 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SPO23	P33757	523 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	LST4	P34239	828 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SCO2	P38072	301 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	CHK1	P38147	527 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	BMT2	P38278	337 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ARN1	P38731	627 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PTC7	P38797	343 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YHR182W	P38870	785 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PFS1	P38872	237 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	OSW5	P40219	148 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PEP8	P40335	379 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SWM2	P40342	146 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YIL054W	P40524	105 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	HIS6	P40545	261 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MAD2	P40958	196 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	IDS2	P46958	469 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PFD1	P46988	109 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	HLJ1	P48353	224 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MRH4	P53166	561 aa		3.37	□□□□□ -1.87

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