RNA–Protein interactions for RNA: YJL036W

SNX4, Transcript of Sorting nexin, yeastyeast

Gene SNX4, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNX4YJL036W APC2Q12440 853 aa3.15□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W AIM45Q12480 344 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W YMR230W-AQ3E7B5 62 aa3.15□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W HEM2P05373 342 aa3.14□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W YCR022CP25620 114 aa3.14□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W ITR1P30605 584 aa3.14□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W NDC1P32500 655 aa3.14□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W MNS1P32906 549 aa3.14□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data3.14□□□□□ -1.91not detected
SNX4YJL036W DHH1P39517 506 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W MST28P39552 234 aa3.14□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W ALG8P40351 577 aa3.14□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W SEC9P40357 651 aa3.14□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W YJL070CP40361 888 aa3.14□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W DIM1P41819 318 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W TOS3P43637 560 aa3.14□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W AZR1P50080 613 aa3.14□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W RPN14P53196 417 aa3.14□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W DBP6P53734 629 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W ALF1P53904 254 aa3.14□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W SPR6Q01684 191 aa3.14□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W TPT1Q12272 230 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W YDR262WQ12331 272 aa3.14□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W YOP1Q12402 180 aa3.14□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W RGS2Q99188 309 aa3.14□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W SLY1P22213 666 aa3.13□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W CIN8P27895 1000 aa3.13□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W YPS1P32329 569 aa3.13□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W EFB1P32471 206 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W YUH1P35127 236 aa3.13□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W PEX18P38855 283 aa3.13□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W YND1P40009 630 aa3.13□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W LCP5P40079 357 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W SIM1P40472 476 aa3.13□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W LOC1P43586 204 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W SFH5P47008 294 aa3.13□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W RIB4P50861 169 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W YGR117CP53270 476 aa3.13□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W FMP42Q04991 504 aa3.13□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W BUR2Q05949 395 aa3.13□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W RRG8Q06109 277 aa3.13□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W VAC14Q06708 880 aa3.13□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W POM152P39685 1337 aa3.13□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W MAS2P11914 482 aa3.12□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W UGA1P17649 471 aa3.12□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W CKI1P20485 582 aa3.12□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W SAR1P20606 190 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W YCL068CP25593 260 aa3.12□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W BUD2P33314 1104 aa3.12□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W MTC4P38335 694 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W BZZ1P38822 633 aa3.12□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W RRT5P43607 289 aa3.12□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W GCD14P46959 383 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W RTT101P47050 842 aa3.12□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W EMC2P47133 292 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W YDL186WP48568 277 aa3.12□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W CAF40P53829 373 aa3.12□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W RRN5Q02983 363 aa3.12□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W SPO19Q03029 223 aa3.12□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W CCE1Q03702 353 aa3.12□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W ECM18Q04623 453 aa3.12□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W BCH1Q05029 724 aa3.12□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W KAP95Q06142 861 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W YOL075CQ08234 1294 aa3.12□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W APC5Q08683 685 aa3.12□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W SNX3Q08826 162 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W SUP35P05453 685 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W MRPL8P22353 238 aa3.11□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W PUT3P25502 979 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W YEF1P32622 495 aa3.11□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W MRPL37P36532 105 aa3.11□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W RIB5P38145 238 aa3.11□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W CHK1P38147 527 aa3.11□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W FAA2P39518 744 aa3.11□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W MPP6P53725 186 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W TRM112P53738 135 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W RPM2Q02773 1202 aa3.11□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W YMR181CQ03231 154 aa3.11□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W YLH47Q06493 454 aa3.11□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W YOR338WQ99326 363 aa3.11□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data3.1□□□□□ -1.91not detected
SNX4YJL036W CAR2P07991 424 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W ATR1P13090 542 aa3.1□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W CAP2P13517 287 aa3.1□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W EXG1P23776 448 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W MXR2P25566 168 aa3.1□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W TOA2P32774 122 aa3.1□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W VAM7P32912 316 aa3.1□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W MYO3P36006 1272 aa3.1□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W MCR1P36060 302 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W PMU1P36069 295 aa3.1□□□□□ -1.91
SNX4YJL036W YKL070WP36087 169 aa3.1□□□□□ -1.91
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