RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	ATP5	P09457	212 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	IRC24	P40580	263 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GEP7	P53171	287 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	STP1	Q00947	519 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RSF1	Q05043	376 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PUS9	Q12069	462 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ALG7	P07286	448 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PTP2	P29461	750 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YSC83	P32792	385 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CSE2	P33308	149 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	FRE2	P36033	711 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	DBP8	P38719	431 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	NDT80	P38830	627 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GPI16	P38875	610 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	AVT2	P39981	480 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	VHR2	P40041	505 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YNL320W	P42840	284 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	XPT1	P47165	209 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YDR366C	P87287	132 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YKR011C	Q02209	353 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PNG1	Q02890	363 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ELC1	Q03071	99 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YET2	Q04210	160 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	UPC2	Q12151	913 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	UBX3	Q12229	455 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	NUP159	P40477	1460 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	COX5B	P00425	151 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	BI2	P03873	423 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	HAP2	P06774	265 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SPT3	P06844	337 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YAK1	P14680	807 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TEC1	P18412	486 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	NSE4	P43124	402 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YAT1	P80235	687 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	FRE3	Q08905	711 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ARG81	P05085	880 aa		2.65	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	AEP1	P32493	518 aa		2.65	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	HXT7	P39004	570 aa		2.65	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ARG2	P40360	574 aa		2.65	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	HIS6	P40545	261 aa		2.65	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SKP1	P52286	194 aa		2.65	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YIP1	P53039	248 aa		2.65	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	IRC25	Q07951	179 aa		2.65	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GEP3	Q08622	556 aa		2.65	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CAN1	P04817	590 aa		2.65	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.65	□□□□□ -1.98	not detected
TOM1	YDR457W	PET54	P10834	293 aa		2.65	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YKL187C	P34231	750 aa		2.65	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ALG3	P38179	458 aa		2.65	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ATX1	P38636	73 aa		2.65	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YIR035C	P40579	254 aa		2.65	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YFL054C	P43549	646 aa		2.65	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	STE24	P47154	453 aa		2.65	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	NUP57	P48837	541 aa		2.65	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	NAT3	Q06504	195 aa		2.65	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	REH1	Q06709	432 aa		2.65	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	DSE3	Q08729	430 aa		2.65	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	FRE7	Q12333	620 aa		2.65	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GAL80	P04387	435 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	YAR066W	P0CX18	203 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	YHR214W	P0CX19	203 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	FUN14	P18411	198 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	HSP30	P25619	332 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	BUB3	P26449	341 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	DAL3	P32459	195 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	FAT1	P38225	669 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	YIL165C	P40446	119 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	VPS62	P53285	467 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	LPP1	Q04396	274 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	YOL029C	Q08187	201 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	NBP2	Q12163	236 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	PFF1	P38244	976 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	AXL2	P38928	823 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	HXT10	P43581	546 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	COA4	Q05809	96 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	RAD10	P06838	210 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	MOD5	P07884	428 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	SAM35	P14693	329 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TOM1	YDR457W	MRP17	P28778	131 aa		2.65	□□□□□ -1.99

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