RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627568.2

TCF4-259, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 806 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-259	ENST00000627568	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		29.13	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	COL4A6	Q14031	1691 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	TFF2	Q03403	129 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	TNFRSF10A	O00220	468 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	ZNF302	Q9NR11	478 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	CPLX1	O14810	134 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	HBP1	O60381	514 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	PRR16	Q569H4	304 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	HLA-C	Q95604	372 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	ADAMTS3	O15072	1205 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	IL17RA	Q96F46	866 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	UIMC1	Q96RL1	719 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		29.08	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	TTC3	P53804	2025 aa		29.08	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	REV3L	O60673	3130 aa		29.08	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	NLRP5	P59047	1200 aa		29.08	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		29.08	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	EPC2	Q52LR7	807 aa		29.08	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		29.08	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	NME8	Q8N427	588 aa		29.08	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	COL1A2	P08123	1366 aa		29.08	■■■□□ 2.25
TCF4-259	ENST00000627568	CD52	P31358	61 aa		29.07	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	KRT76	Q01546	638 aa		29.07	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	PTPRO	Q16827	1216 aa		29.07	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		29.07	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	FIBCD1	Q8N539	461 aa		29.07	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		29.07	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	ENPP3	O14638	875 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	KLRC1	P26715	233 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	CIITA	P33076	1130 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	KCNQ1	P51787	676 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	PAK2	Q13177	524 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	EVPL	Q92817	2033 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	PSAP	P07602	524 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	TMEM192	Q8IY95	271 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	SAMM50	Q9Y512	469 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		29.04	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	DEXI	O95424	95 aa		29.04	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	BMP1	P13497	986 aa		29.04	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		29.04	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		29.04	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568		H3BNC9	293 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	STK3	Q13188	491 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	GPM6B	Q13491	265 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	PADI3	Q9ULW8	664 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	GINS2	Q9Y248	185 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	MUC3A	Q02505	3323 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	WDR64	B1ANS9	1081 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	CTNNB1	P35222	781 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	USP11	P51784	963 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	LENG9	Q96B70	501 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TCF4-259	ENST00000627568	WDR81	Q562E7	1941 aa		29.02	■■■□□ 2.24

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