RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592052.1

TMEM259-208, Transcript of transmembrane protein 259, human

Gene TMEM259, Length 1,637 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM259-208	ENST00000592052	C4orf19	Q8IY42	314 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	ARVCF	O00192	962 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	MUT	P22033	750 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	XKR3	Q5GH77	459 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	CABP7	Q86V35	215 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	HBP1	O60381	514 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	LYPLA2	O95372	231 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	SPECC1	Q5M775	1068 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	SLC26A4	O43511	780 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	TXLNA	P40222	546 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	SESTD1	Q86VW0	696 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	EPSTI1	Q96J88	318 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	PPFIA1	Q13136	1202 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	NRCAM	Q92823	1304 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	INSRR	P14616	1297 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	CDK7	P50613	346 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	SNX17	Q15036	470 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	POTEG	Q6S5H5	508 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	CALML4	Q96GE6	196 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	NACC1	Q96RE7	527 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	STBD1	O95210	358 aa		27.7	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	GNAT1	P11488	350 aa		27.7	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	GRIK4	Q16099	956 aa		27.7	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	ECM1	Q16610	540 aa		27.7	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		27.7	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	HYI	Q5T013	277 aa		27.7	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	USP49	Q70CQ1	688 aa		27.7	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	ANO5	Q75V66	913 aa		27.7	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	SETD4	Q9NVD3	440 aa		27.7	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	ADAL	Q6DHV7	355 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	COL1A2	P08123	1366 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	27.69	■■■□□ 2.02	1e-15	■□□□□ 10.2
TMEM259-208	ENST00000592052	HOXC8	P31273	242 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	SHC4	Q6S5L8	630 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	TCHH	Q07283	1943 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	WDR81	Q562E7	1941 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	ZBTB39	O15060	712 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	IGBP1	P78318	339 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	DNM3	Q9UQ16	869 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	TMEM150B	A6NC51	233 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	GRB10	Q13322	594 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	TRIM60	Q495X7	471 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	RESP18	Q5W5W9	173 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	PNMA5	Q96PV4	448 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	RTP1	P59025	263 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	MTERF2	Q49AM1	385 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TMEM259-208	ENST00000592052	CEP170P1	Q96L14	293 aa		27.67	■■■□□ 2.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms