RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-215ENST00000589825 GABBR1Q9UBS5 961 aa18.19■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa18.19■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 COL1A2P08123 1366 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 M0R2N6 131 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 CHMP2AO43633 222 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 MARCH6O60337 910 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 CTDNEP1O95476 244 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 CHRNA1P02708 482 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 GHRP10912 638 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 IGFBP4P22692 258 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 SFNP31947 248 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 JAK3P52333 1124 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 LETM2Q2VYF4 491 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM117BQ6P1L5 589 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 MTHFD1LQ6UB35 978 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 MOXD1Q6UVY6 613 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 NME8Q8N427 588 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 LENG9Q96B70 501 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM167AQ96KS9 214 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 RAD9AQ99638 391 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 DISC1Q9NRI5 854 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 CEP131Q9UPN4 1083 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 CDY2AQ9Y6F7 541 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa18.17■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa18.17■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 GJB5O95377 273 aa18.17■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 LARGE1O95461 756 aa18.17■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 TDP2O95551 362 aa18.17■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 CYP3A7P24462 503 aa18.17■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 KLRC1P26715 233 aa18.17■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 KRT2P35908 639 aa18.17■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 TCTN1Q2MV58 587 aa18.17■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 NEK8Q86SG6 692 aa18.17■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC5A5Q92911 643 aa18.17■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 MICAL3Q7RTP6 2002 aa18.16■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 DTNBO60941 627 aa18.16■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 NPY5RQ15761 445 aa18.16■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 C8orf34Q49A92 452 aa18.16■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP18.16■□□□□ 0.52e-7■□□□□ 8.2
EFTUD2-215ENST00000589825 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa18.16■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 MIER3Q7Z3K6 550 aa18.16■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 USP38Q8NB14 1042 aa18.16■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 ZBTB10Q96DT7 871 aa18.16■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 CERS4Q9HA82 394 aa18.16■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 NRBP2Q9NSY0 501 aa18.16■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 GJB4Q9NTQ9 266 aa18.16■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 INSL6Q9Y581 213 aa18.16■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 TRPV2Q9Y5S1 764 aa18.16■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 UPP2O95045 317 aa18.15■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 MGAT3Q09327 533 aa18.15■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 TMEM62Q0P6H9 643 aa18.15■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 FBXO47Q5MNV8 452 aa18.15■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa18.15■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 RDM1Q8NG50 284 aa18.15■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 PPM1EQ8WY54 764 aa18.15■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 ARNTL2Q8WYA1 636 aa18.15■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 UNC45AQ9H3U1 944 aa18.15■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 PTPRSQ13332 1948 aa18.15■□□□□ 0.5
EFTUD2-215ENST00000589825 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 EDIL3O43854 480 aa18.14■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 PSMD10O75832 226 aa18.14■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 FDPSP14324 419 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 TAP1Q03518 808 aa18.14■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 LPIN1Q14693 890 aa18.14■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 PPP4R3AQ6IN85 833 aa18.14■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 METTL13Q8N6R0 699 aa18.14■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 GJA10Q969M2 543 aa18.14■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 YME1L1Q96TA2 773 aa18.14■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 GINS2Q9Y248 185 aa18.14■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 SQORQ9Y6N5 450 aa18.14■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 COL6A3P12111 3177 aa18.14■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa18.14■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 MAGEB2O15479 319 aa18.13■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 BAG4O95429 457 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 OATP04181 439 aa18.13■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 ATP4AP20648 1035 aa18.13■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 TMOD1P28289 359 aa18.13■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 FOSBP53539 338 aa18.13■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP18.13■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 ODR4Q5SWX8 454 aa18.13■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 CCDC83Q8IWF9 413 aa18.13■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP18.13■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 OXER1Q8TDS5 423 aa18.13■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM20AQ96MK3 541 aa18.13■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 MBOAT7Q96N66 472 aa18.13■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 FTHL17Q9BXU8 183 aa18.13■□□□□ 0.49
EFTUD2-215ENST00000589825 OSBPL7Q9BZF2 842 aa18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms