RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561407.1

TMOD2-206, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD2, Length 535 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-206ENST00000561407 MCM8Q9UJA3 840 aa4.89□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 DSEQ9UL01 958 aa4.89□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 MAPRE3Q9UPY8 281 aa4.89□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 B8ZZF3 427 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 EFCAB14O75071 495 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 RASGRP1O95267 797 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 AMY2AP04746 511 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 AMY2BP19961 511 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 KCNC1P48547 511 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 NEK2P51955 445 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 EPHA5P54756 1037 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 ADAM9Q13443 819 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 NFIXQ14938 502 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 C16orf59Q7L2K0 433 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 OSTM1Q86WC4 334 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 TRIM48Q8IWZ4 208 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 TTLL11Q8NHH1 800 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 FBXW5Q969U6 566 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 SPATA25Q9BR10 227 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 CD244Q9BZW8 370 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 UBA5Q9GZZ9 404 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 PCDH18Q9HCL0 1135 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 RTEL1Q9NZ71 1219 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 HSPBP1Q9NZL4 362 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 ZIM2Q9NZV7 527 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 CBLCQ9ULV8 474 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 PLD2O14939 933 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 CAND2O75155 1236 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 CKMP06732 381 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 PDE6AP16499 860 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 KCNA6P17658 529 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 NAT1P18440 290 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 THBS2P35442 1172 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 GPR19Q15760 415 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 PRR31Q5SQ13 230 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 KCTD1Q719H9 257 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 BRAPQ7Z569 592 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 FGD2Q7Z6J4 655 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 LRRTM3Q86VH5 581 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 PROSER1Q86XN7 944 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 CARFQ8N187 725 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 MYO1HQ8N1T3 1032 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 ARPC5LQ9BPX5 153 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 CDH19Q9H159 772 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 ADAM7Q9H2U9 754 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 TRIM39Q9HCM9 518 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 CATSPERZQ9NTU4 200 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 COMMD10Q9Y6G5 202 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 NCANO14594 1321 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 ACOT7O00154 380 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 PRRG2O14669 202 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 FAHP16930 419 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 ATF3P18847 181 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 SARSP49591 514 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 JAM2P57087 298 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 RTP5Q14D33 572 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 CNNM4Q6P4Q7 775 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 TTLL7Q6ZT98 887 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 CHPFQ8IZ52 775 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 SAMD3Q8N6K7 520 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 TTLL6Q8N841 843 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 ATL2Q8NHH9 583 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 MTFR1LQ9H019 292 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 PNMA2Q9UL42 364 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 NUB1Q9Y5A7 615 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 CECR2Q9BXF3 1484 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa4.85□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 CCDC189A1A4V9 331 aa4.85□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 CCDC66A2RUB6 948 aa4.85□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 FAM90A27PA6NNH2 459 aa4.85□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4.85□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 MAN2B1O00754 1011 aa4.85□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 RPL13P26373 211 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 DNM2P50570 870 aa4.85□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 ST5P78524 1137 aa4.85□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 NT5DC1Q5TFE4 455 aa4.85□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 ABHD17CQ6PCB6 329 aa4.85□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 TMC5Q6UXY8 1006 aa4.85□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 FRMD5Q7Z6J6 570 aa4.85□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TMOD2-206ENST00000561407 HOOK2Q96ED9 719 aa4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms