RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555676.5

RBM23-216, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 4

Gene RBM23, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-216	ENST00000555676	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	SREBF1	P36956	1147 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	PBX2	P40425	430 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	USP11	P51784	963 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	ZNF445	P59923	1031 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	AP3B2	Q13367	1082 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	GBF1	Q92538	1859 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	MEIS1	O00470	390 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	CKB	P12277	381 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	DNAJB2	P25686	324 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	RFC2	P35250	354 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	PRPH	P41219	470 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	ARHGAP4	P98171	946 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	PTK7	Q13308	1070 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	CEP55	Q53EZ4	464 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	NEK8	Q86SG6	692 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	CAGE1	Q8TC20	777 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	TIGD1	Q96MW7	591 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	PBX4	Q9BYU1	374 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	SETD4	Q9NVD3	440 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	KAT6A	Q92794	2004 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	ZBBX	A8MT70	800 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	TREH	O43280	583 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	SELP	P16109	830 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	ATP2B1	P20020	1258 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	HOXC8	P31273	242 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	ZNF76	P36508	570 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	RBL2	Q08999	1139 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	SERINC5	Q86VE9	423 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	FSIP1	Q8NA03	581 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	UIMC1	Q96RL1	719 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	USP25	Q9UHP3	1055 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	FAM86B1	E9PN63	330 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	NBN	O60934	754 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	PFKM	P08237	780 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	CYP3A4	P08684	503 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	RABGGTB	P53611	331 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	PTGDR	Q13258	359 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	MBTPS1	Q14703	1052 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	ZNF174	Q15697	407 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	TCTN1	Q2MV58	587 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	RESP18	Q5W5W9	173 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	KANK3	Q6NY19	840 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	PCYT2	Q99447	389 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	DACT1	Q9NYF0	836 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-216	ENST00000555676	COL6A3	P12111	3177 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM23-216	ENST00000555676	MYO9B	Q13459	2157 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM23-216	ENST00000555676	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM23-216	ENST00000555676	EDIL3	O43854	480 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM23-216	ENST00000555676	CAVIN2	O95810	425 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM23-216	ENST00000555676	MARK3	P27448	753 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM23-216	ENST00000555676	ADAM17	P78536	824 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM23-216	ENST00000555676	GRIN2C	Q14957	1233 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM23-216	ENST00000555676	INF2	Q27J81	1249 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM23-216	ENST00000555676	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
RBM23-216	ENST00000555676	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM23-216	ENST00000555676	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM23-216	ENST00000555676	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms