RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553309.5

ATXN3-218, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,022 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-218ENST00000553309 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa7.18□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa7.18□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 EXOC2Q96KP1 924 aa7.18□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 XYLT2Q9H1B5 865 aa7.18□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 AQP7O14520 342 aa7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 SLC27A2O14975 620 aa7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 GNAT1P11488 350 aa7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 ATF3P18847 181 aa7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 CYP4F22Q6NT55 531 aa7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 LILRA6Q6PI73 481 aa7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 SP8Q8IXZ3 490 aa7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 KYQ8NBH2 561 aa7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 CLEC4DQ8WXI8 215 aa7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 C20orf173Q96LM9 149 aa7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 ALG1Q9BT22 464 aa7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 IPPKQ9H8X2 491 aa7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 SETD5Q9C0A6 1442 aa7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa7.17□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 TET3O43151 1660 aa7.16□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 LRG1P02750 347 aa7.16□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 SARSP49591 514 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 CARFQ8N187 725 aa7.16□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 TTLL6Q8N841 843 aa7.16□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 DRC1Q96MC2 740 aa7.16□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 SPATA25Q9BR10 227 aa7.16□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 DTLQ9NZJ0 730 aa7.16□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa7.16□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 PIK3C2BO00750 1634 aa7.16□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 ITGA1P56199 1179 aa7.15□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 CTSWP56202 376 aa7.15□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 GABREP78334 506 aa7.15□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 GUCY1A3Q02108 690 aa7.15□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 GRIN1Q05586 938 aa7.15□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 PAK1Q13153 545 aa7.15□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 TEPPQ6URK8 271 aa7.15□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 OSBPL2Q9H1P3 480 aa7.15□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 NTMQ9P121 344 aa7.15□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 NUB1Q9Y5A7 615 aa7.15□□□□□ -1.26
ATXN3-218ENST00000553309 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa7.15□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa7.14□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 THBS2P35442 1172 aa7.14□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 TUSC3Q13454 348 aa7.14□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 LCE4AQ5TA78 99 aa7.14□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 LILRB2Q8N423 598 aa7.14□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 DSEQ9UL01 958 aa7.14□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa7.14□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 CEP152O94986 1710 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 MBD5Q9P267 1494 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 CCNB3Q8WWL7 1395 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 LTFP02788 710 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 RPL13P26373 211 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 PCDH19Q8TAB3 1148 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 EFCAB6Q5THR3 1501 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 CCDC18Q5T9S5 1454 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 NAT1P18440 290 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 NFE2L2Q16236 605 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 NT5DC1Q5TFE4 455 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 JMYQ8N9B5 988 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 FBXW5Q969U6 566 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 CATSPERZQ9NTU4 200 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 MROH1Q8NDA8 1641 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 UNC13BO14795 1591 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa7.11□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 CRTAMO95727 393 aa7.11□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 ADAM9Q13443 819 aa7.11□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 TMC5Q6UXY8 1006 aa7.11□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 OSTM1Q86WC4 334 aa7.11□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 TTLL11Q8NHH1 800 aa7.11□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 RELTQ969Z4 430 aa7.11□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 CLIC6Q96NY7 704 aa7.11□□□□□ -1.27
ATXN3-218ENST00000553309 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms