RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	CASC1	Q6TDU7	716 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	TMTC2	Q8N394	836 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF592	Q92610	1267 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	PIK3CD	O00329	1044 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	DLL1	O00548	723 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	STAM2	O75886	525 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	FOSL2	P15408	326 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	GUCY2C	P25092	1073 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	ICAM3	P32942	547 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	KIF5B	P33176	963 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	GNAQ	P50148	359 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	NEK4	P51957	841 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	CAGE1	Q8TC20	777 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	MYL10	Q9BUA6	226 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	MSRA	Q9UJ68	235 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	MYO9B	Q13459	2157 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	CALM1	P0DP23	149 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	CALM2	P0DP24	149 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	CALM3	P0DP25	149 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	PLA2G4A	P47712	749 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	SP2	Q02086	613 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	GPNMB	Q14956	572 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	PTGIS	Q16647	500 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	RETREG2	Q8NC44	543 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	CCDC69	A6NI79	296 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	MEIS2	O14770	477 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	PPFIA4	O75335	1185 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	GGPS1	O95749	300 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	HOXC8	P31273	242 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	UBE2H	P62256	183 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	SEMA3F	Q13275	785 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	7.31	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	CXCL10	P02778	98 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF286B	P0CG31	522 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	ACTN1	P12814	892 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	PTK7	Q13308	1070 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	CNPY4	Q8N129	248 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	SPATA33	Q96N06	139 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	SLC9A7	Q96T83	725 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	KAT6A	Q92794	2004 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	ZBBX	A8MT70	800 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	BAIAP3	O94812	1187 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	SELP	P16109	830 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	MCM2	P49736	904 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FGD4-215	ENST00000551984	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24

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