RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 TBX3O15119 743 aa6.33□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 TLL1O43897 1013 aa6.33□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 SORBS3O60504 671 aa6.33□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 LGR5O75473 907 aa6.33□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 ITGB8P26012 769 aa6.33□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 KRT2P35908 639 aa6.33□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNQ1P51787 676 aa6.33□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 GRIK4Q16099 956 aa6.33□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 PKN1Q16512 942 aa6.33□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 Q4G0T1 1027 aa6.33□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 TBCKQ8TEA7 893 aa6.33□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 IL17RAQ96F46 866 aa6.33□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 SCLYQ96I15 445 aa6.33□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 FBXL18Q96ME1 805 aa6.33□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 PKD2L1Q9P0L9 805 aa6.33□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 INSL6Q9Y581 213 aa6.33□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 STK24Q9Y6E0 443 aa6.33□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 COL1A2P08123 1366 aa6.32□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 ATG7O95352 703 aa6.32□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 STAG3L1P0CL83 205 aa6.32□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 SEMA3FQ13275 785 aa6.32□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM63BQ5T3F8 832 aa6.32□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 ATP8B4Q8TF62 1192 aa6.32□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 RSPH1Q8WYR4 309 aa6.32□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 GTF3C6Q969F1 213 aa6.32□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 RAD9AQ99638 391 aa6.32□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 WNT8AQ9H1J5 351 aa6.32□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 PKD1L2Q7Z442 2459 aa6.31□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa6.31□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa6.31□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 GPR182O15218 404 aa6.31□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 TREHO43280 583 aa6.31□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 ARP10275 920 aa6.31□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 CYP3A7P24462 503 aa6.31□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 LETM2Q2VYF4 491 aa6.31□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 TYW1BQ6NUM6 668 aa6.31□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 ERMNQ8TAM6 284 aa6.31□□□□□ -1.4
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CLSTN3-215ENST00000544584 PPP2R3CQ969Q6 453 aa6.31□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 PGBD1Q96JS3 809 aa6.31□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 C8orf76Q96K31 380 aa6.31□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 SCLT1Q96NL6 688 aa6.31□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.31□□□□□ -1.4
CLSTN3-215ENST00000544584 PBX4Q9BYU1 374 aa6.31□□□□□ -1.4
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