RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534401.5

PKP3-211, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene PKP3, Length 756 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-211ENST00000534401 RSPH10B2B2RC85 870 aa24.1■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 WNT7AO00755 349 aa24.1■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 RSPH10BP0C881 870 aa24.1■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 THPOP40225 353 aa24.1■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 GUCY1B3Q02153 619 aa24.1■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP24.1■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 ZNF484Q5JVG2 852 aa24.1■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 OTOP2Q7RTS6 562 aa24.1■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 GABBR1Q9UBS5 961 aa24.1■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa24.1■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 TRPC6Q9Y210 931 aa24.1■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 FOSBP53539 338 aa24.09■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 SPIRE1Q08AE8 756 aa24.09■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 MGAT3Q09327 533 aa24.09■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 CUL4AQ13619 759 aa24.09■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 FAM184AQ8NB25 1140 aa24.09■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 SIP14410 1827 aa24.09■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 BAIAP3O94812 1187 aa24.08■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 STBD1O95210 358 aa24.08■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 TCTN1Q2MV58 587 aa24.08■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 MTHFD1LQ6UB35 978 aa24.08■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 POTEDQ86YR6 584 aa24.08■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa24.08■■□□□ 1.45
PKP3-211ENST00000534401 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa24.07■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 EML1O00423 815 aa24.07■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 CHRNA1P02708 482 aa24.07■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 ACTN1P12814 892 aa24.07■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 UGCGQ16739 394 aa24.07■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa24.07■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 CNKSR3Q6P9H4 555 aa24.07■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 MIER3Q7Z3K6 550 aa24.07■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 FAM167AQ96KS9 214 aa24.07■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 MTMR9Q96QG7 549 aa24.07■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 OSBPL7Q9BZF2 842 aa24.07■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 PTPRSQ13332 1948 aa24.06■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 KLRC1P26715 233 aa24.06■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 SLFN12Q8IYM2 578 aa24.06■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 KIF3AQ9Y496 699 aa24.06■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 SAMM50Q9Y512 469 aa24.06■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 MICAL3Q7RTP6 2002 aa24.05■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 KIF28PB7ZC32 967 aa24.05■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 IGBP1P78318 339 aa24.05■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 RSPH3Q86UC2 560 aa24.05■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 NOSTRINQ8IVI9 506 aa24.05■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 NME8Q8N427 588 aa24.05■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 LINC01465Q8N7H1 131 aa24.05■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa24.05■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 DNAJB3Q8WWF6 145 aa24.05■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 ZBTB10Q96DT7 871 aa24.05■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 CEP89Q96ST8 783 aa24.05■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa24.05■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 SQORQ9Y6N5 450 aa24.05■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa24.05■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 GBF1Q92538 1859 aa24.04■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa24.04■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 TMEM265A0A087WTH1 108 aa24.04■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa24.04■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 CHMP2AO43633 222 aa24.04■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 C22orf31O95567 290 aa24.04■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 OATP04181 439 aa24.04■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 TRAPPC10P48553 1259 aa24.04■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa24.04■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 NRBP2Q9NSY0 501 aa24.04■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 GRXCR1A8MXD5 290 aa24.03■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 EFCAB14O75071 495 aa24.03■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 BAG4O95429 457 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 GJB2P29033 226 aa24.03■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 PRKCEQ02156 737 aa24.03■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 EPHA7Q15375 998 aa24.03■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 DBF4BQ8NFT6 615 aa24.03■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 CEP131Q9UPN4 1083 aa24.03■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 CHD9Q3L8U1 2897 aa24.03■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 NEMFO60524 1076 aa24.02■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 CTSHP09668 335 aa24.02■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 PSMC5P62195 406 aa24.02■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 XKR3Q5GH77 459 aa24.02■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 CKAP2LQ8IYA6 745 aa24.02■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 SLC9A7Q96T83 725 aa24.02■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 PBX4Q9BYU1 374 aa24.02■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 TMEM60Q9H2L4 133 aa24.02■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 MTMR10Q9NXD2 777 aa24.02■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PKP3-211ENST00000534401 MAGEB2O15479 319 aa24.01■■□□□ 1.43
PKP3-211ENST00000534401 P4HBP07237 508 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
PKP3-211ENST00000534401 DNAJB2P25686 324 aa24.01■■□□□ 1.43
PKP3-211ENST00000534401 WDR5P61964 334 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
PKP3-211ENST00000534401 CALCRLQ16602 461 aa24.01■■□□□ 1.43
PKP3-211ENST00000534401 FBXO47Q5MNV8 452 aa24.01■■□□□ 1.43
PKP3-211ENST00000534401 C4orf32Q8N8J7 132 aa24.01■■□□□ 1.43
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