RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527217.1

AP003499.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AP003499.1, Length 574 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP003499.1-201ENST00000527217 CCND2P30279 289 aa9.5□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 ARHGAP4P98171 946 aa9.5□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 CCDC178Q5BJE1 867 aa9.5□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa9.5□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 IQCA1Q86XH1 822 aa9.5□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 STAG2Q8N3U4 1231 aa9.5□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 PLVAPQ9BX97 442 aa9.5□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 EHMT1Q9H9B1 1298 aa9.5□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.5□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 B4E1Z4 1266 aa9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 DGKIO75912 1065 aa9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 ITGB1P05556 798 aa9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 VCPP55072 806 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 MGAT3Q09327 533 aa9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 COASYQ13057 564 aa9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 LPIN1Q14693 890 aa9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 ANKRD45Q5TZF3 282 aa9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 TREML4Q6UXN2 200 aa9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 RUFY4Q6ZNE9 571 aa9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 CYFIP1Q7L576 1253 aa9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 FCHSD1Q86WN1 690 aa9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 TRIM50Q86XT4 487 aa9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 SAMD3Q8N6K7 520 aa9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 EFHBQ8N7U6 833 aa9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 SMRP1Q8NCR6 262 aa9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 SPPL3Q8TCT6 385 aa9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 LMBR1Q8WVP7 490 aa9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 P2RX5Q93086 422 aa9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 PPP2R3CQ969Q6 453 aa9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 MTMR8Q96EF0 704 aa9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 GPR20Q99678 358 aa9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 ZSWIM5Q9P217 1185 aa9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 TELO2Q9Y4R8 837 aa9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa9.49□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 MYO10Q9HD67 2058 aa9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 FAM187AA6NFU0 413 aa9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 KLRF2D3W0D1 207 aa9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 RNF223E7ERA6 249 aa9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 ZBTB5O15062 677 aa9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 GLP2RO95838 553 aa9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 POLR2MP0CAP2 368 aa9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 AVPR2P30518 371 aa9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 ICAM3P32942 547 aa9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 NRIP1P48552 1158 aa9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 PDE1AP54750 535 aa9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 SIGLEC14Q08ET2 396 aa9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 SEMA3FQ13275 785 aa9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 NEDD9Q14511 834 aa9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 NAALADL2Q58DX5 795 aa9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 METTL7BQ6UX53 244 aa9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 KLHL23Q8NBE8 558 aa9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 POF1BQ8WVV4 589 aa9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 ASIC4Q96FT7 647 aa9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 RTEL1Q9NZ71 1219 aa9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 NRCAMQ92823 1304 aa9.48□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa9.47□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 H0Y858 1186 aa9.47□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 NT5C2P49902 561 aa9.47□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 SP4Q02446 784 aa9.47□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 GNPTABQ3T906 1256 aa9.47□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 FBXO47Q5MNV8 452 aa9.47□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 TICAM2Q86XR7 235 aa9.47□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 DNAJB3Q8WWF6 145 aa9.47□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 LINC01599Q8WXQ3 324 aa9.47□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 RILPL2Q969X0 211 aa9.47□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa9.47□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 TLR9Q9NR96 1032 aa9.47□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 MAD2L2Q9UI95 211 aa9.47□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa9.47□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 SPTBN4Q9H254 2564 aa9.46□□□□□ -0.89
AP003499.1-201ENST00000527217 PER2O15055 1255 aa9.46□□□□□ -0.9
AP003499.1-201ENST00000527217 FIBPO43427 364 aa9.46□□□□□ -0.9
AP003499.1-201ENST00000527217 PPFIA3O75145 1194 aa9.46□□□□□ -0.9
AP003499.1-201ENST00000527217 STAM2O75886 525 aa9.46□□□□□ -0.9
AP003499.1-201ENST00000527217 SDSP20132 328 aa9.46□□□□□ -0.9
AP003499.1-201ENST00000527217 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
AP003499.1-201ENST00000527217 RBM10P98175 930 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
AP003499.1-201ENST00000527217 FOXK2Q01167 660 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms