RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502478.1

CCSER1-202, Transcript of coiled-coil serine rich protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCSER1, Length 744 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1-202ENST00000502478 AMY2BP19961 511 aa6.7□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 PTGS1P23219 599 aa6.7□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 STILQ15468 1287 aa6.7□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.7□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 PTPRN2Q92932 1015 aa6.7□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 FBXW5Q969U6 566 aa6.7□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 MSL2Q9HCI7 577 aa6.7□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 FBXO10Q9UK96 956 aa6.7□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.7□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 NR2E1Q9Y466 385 aa6.7□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 CECR2Q9BXF3 1484 aa6.7□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 ARVCFO00192 962 aa6.69□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 ARHGAP6O43182 974 aa6.69□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 ADCY3O60266 1144 aa6.69□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 HMGCRP04035 888 aa6.69□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 PDE6AP16499 860 aa6.69□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 AOAHP28039 575 aa6.69□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 PTH1RQ03431 593 aa6.69□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 FHL2Q14192 279 aa6.69□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.69□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.69□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.69□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 EXTL1Q92935 676 aa6.69□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 FAM89AQ96GI7 184 aa6.69□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 OR14A2Q96R54 314 aa6.69□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.69□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 INCENPQ9NQS7 918 aa6.69□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 GALNT8Q9NY28 637 aa6.69□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 BTBD7Q9P203 1132 aa6.69□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 CBLCQ9ULV8 474 aa6.69□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa6.68□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.68□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 PLSCR1O15162 318 aa6.68□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 ZNF202O95125 648 aa6.68□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 PYGMP11217 842 aa6.68□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 ABHD18Q0P651 414 aa6.68□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 TBR1Q16650 682 aa6.68□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 SPATC1Q76KD6 591 aa6.68□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.68□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 OSTM1Q86WC4 334 aa6.68□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 CFHR4Q92496 578 aa6.68□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 WNK4Q96J92 1243 aa6.68□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.68□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.68□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.68□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 NARSO43776 548 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 MC4RP32245 332 aa6.67□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 KCNQ1P51787 676 aa6.67□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 HERVK_113P62684 666 aa6.67□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.67□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.66□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 MPIG6BO95866 241 aa6.66□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 NAT1P18440 290 aa6.66□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 KRT15P19012 456 aa6.66□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 ACRV1P26436 265 aa6.66□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 ADCY8P40145 1251 aa6.66□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 JAM2P57087 298 aa6.66□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 TGFB2P61812 414 aa6.66□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 GUCY1A3Q02108 690 aa6.66□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.66□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 USP30Q70CQ3 517 aa6.66□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 AMER2Q8N7J2 671 aa6.66□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 BTBD2Q9BX70 525 aa6.66□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 CSRNP2Q9H175 543 aa6.66□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.65□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 PDPK1O15530 556 aa6.65□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 ST5P78524 1137 aa6.65□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 DGCR2P98153 550 aa6.65□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 CRY1Q16526 586 aa6.65□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 FAM209AQ5JX71 171 aa6.65□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.65□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 KANK2Q63ZY3 851 aa6.65□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.65□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 C1orf210Q8IVY1 113 aa6.65□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 IL17DQ8TAD2 202 aa6.65□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 CDC6Q99741 560 aa6.65□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.65□□□□□ -1.34
CCSER1-202ENST00000502478 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa6.65□□□□□ -1.35
CCSER1-202ENST00000502478 GSTA4O15217 222 aa6.64□□□□□ -1.35
CCSER1-202ENST00000502478 GABREP78334 506 aa6.64□□□□□ -1.35
CCSER1-202ENST00000502478 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCSER1-202ENST00000502478 RASGRF1Q13972 1273 aa6.64□□□□□ -1.35
CCSER1-202ENST00000502478 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.64□□□□□ -1.35
CCSER1-202ENST00000502478 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.64□□□□□ -1.35
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