RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490088.2

HOXD10-202, Transcript of homeobox D10, humanhuman

TSL 2

Gene HOXD10, Length 1,010 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10-202ENST00000490088 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
HOXD10-202ENST00000490088 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD10-202ENST00000490088 GDPD2Q9HCC8 539 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD10-202ENST00000490088 RPA1P27694 616 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 ME1P48163 572 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 CDK7P50613 346 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 SNX17Q15036 470 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 TUFT1Q9NNX1 390 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 STK24Q9Y6E0 443 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 TMEM150BA6NC51 233 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 STBD1O95210 358 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 INSRRP14616 1297 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 PPFIA1Q13136 1202 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 HIC1Q14526 733 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 ECM1Q16610 540 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 TRIM60Q495X7 471 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 POTEGQ6S5H5 508 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 SESTD1Q86VW0 696 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 C4orf19Q8IY42 314 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 FAM167AQ96KS9 214 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 SETD4Q9NVD3 440 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 PCDHA7Q9UN72 937 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 DNAH12Q6ZR08 3092 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 A0A087WWV3 80 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 C17orf102A2RUQ5 167 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 DDX11L8A8MPP1 907 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 HBP1O60381 514 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 CUTAO60888 179 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 RTP1P59025 263 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 IGBP1P78318 339 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 XKR3Q5GH77 459 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 C1orf53Q5VUE5 145 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 USP49Q70CQ1 688 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 CABP7Q86V35 215 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 EPSTI1Q96J88 318 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 NRBP2Q9NSY0 501 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 WDR81Q562E7 1941 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 ZBTB39O15060 712 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 LYPLA2O95372 231 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 UBA7P41226 1012 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 GRIK4Q16099 956 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 PLA2G4FQ68DD2 849 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 SH2D3AQ9BRG2 576 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 TRPV6Q9H1D0 765 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 NRCAMQ92823 1304 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 B4GALT4O60513 344 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 HOXC8P31273 242 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 YWHABP31946 246 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 TLE2Q04725 743 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 ANO5Q75V66 913 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 FAM126BQ8IXS8 530 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 PIGOQ8TEQ8 1089 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 PLIN2Q99541 437 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 KIAA1024Q9UPX6 916 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 MROH7Q68CQ1 1323 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 ZBTB42B2RXF5 422 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 MUTP22033 750 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 GRB10Q13322 594 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 KARSQ15046 597 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 MTERF2Q49AM1 385 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 ZNF484Q5JVG2 852 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 ZBTB10Q96DT7 871 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 PNMA5Q96PV4 448 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 TCHHQ07283 1943 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD10-202ENST00000490088 RRN3P2A6NIE6 340 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD10-202ENST00000490088 TREHO43280 583 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD10-202ENST00000490088 NPEPPSP55786 919 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD10-202ENST00000490088 PTGISQ16647 500 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD10-202ENST00000490088 HYIQ5T013 277 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD10-202ENST00000490088 MARCH8Q5T0T0 291 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD10-202ENST00000490088 SHC4Q6S5L8 630 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD10-202ENST00000490088 RASSF8Q8NHQ8 419 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD10-202ENST00000490088 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD10-202ENST00000490088 NACC1Q96RE7 527 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD10-202ENST00000490088 HTATIP2Q9BUP3 242 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD10-202ENST00000490088 CCSER1Q9C0I3 900 aa24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms