RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487036.1

FAM208A-208, Transcript of family with sequence similarity 208 member A, human

TSL 3

Gene FAM208A, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM208A-208	ENST00000487036	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	MYOT	Q9UBF9	498 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	PRODH	O43272	600 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	DLX3	O60479	287 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	GYS2	P54840	703 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	GFRA1	P56159	465 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	LSAMP	Q13449	338 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	TCEA2	Q15560	299 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	ZG16B	Q96DA0	208 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	MATN2	O00339	956 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	IL18BP	O95998	194 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	CKM	P06732	381 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	KRT4	P19013	534 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	NTRK3	Q16288	839 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	NSMF	Q6X4W1	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	CDC6	Q99741	560 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	PLD2	O14939	933 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	RFPL3	O75679	317 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	RAPGEF3	O95398	923 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	CR2	P20023	1033 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	ACRV1	P26436	265 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	HOXC12	P31275	282 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	MAP4K2	Q12851	820 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	KCNAB2	Q13303	367 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	VASN	Q6EMK4	673 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	PLAA	Q9Y263	795 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	BLACE	A4D250	179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	MYO1B	O43795	1136 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	CLSTN1	O94985	981 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	MASP1	P48740	699 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	NINJ1	Q92982	152 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	IFT57	Q9NWB7	429 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	CLDND1	Q9NY35	253 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208A-208	ENST00000487036	ASXL2	Q76L83	1435 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036		A0A087X0B3	334 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	FAM83G	A6ND36	823 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	KCNQ2	O43526	872 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	DNAJC6	O75061	913 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	DGKI	O75912	1065 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	LTBR	P36941	435 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	GLRB	P48167	497 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	RAC3	P60763	192 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	GRIN1	Q05586	938 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM208A-208	ENST00000487036	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms