RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.371e-22■■□□□ 11.6
ACTB-211ENST00000480301 TANC1Q9C0D5 1861 aa23.64■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 KAT6AQ92794 2004 aa23.64■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 GPR153Q6NV75 609 aa23.63■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 VAV3Q9UKW4 847 aa23.63■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 TET1Q8NFU7 2136 aa23.63■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB42B2RXF5 422 aa23.62■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 KIF28PB7ZC32 967 aa23.62■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 ZNF862O60290 1169 aa23.62■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 CTSHP09668 335 aa23.62■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 PPP2R5CQ13362 524 aa23.62■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 ZNF484Q5JVG2 852 aa23.62■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 FAM26DQ5JW98 314 aa23.62■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 MTHFD1LQ6UB35 978 aa23.62■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa23.62■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 EML1O00423 815 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 GJB2P29033 226 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 UGCGQ16739 394 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 TCTN1Q2MV58 587 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 CKAP2LQ8IYA6 745 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 DNAJB3Q8WWF6 145 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 OSBPL7Q9BZF2 842 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 COL1A2P08123 1366 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 GRXCR1A8MXD5 290 aa23.6■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 CHRNA1P02708 482 aa23.6■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 ACTN1P12814 892 aa23.6■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.6■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 KIF3AQ9Y496 699 aa23.6■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 SZT2Q5T011 3432 aa23.6■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 ZBBXA8MT70 800 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 MARCH6O60337 910 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 BAG4O95429 457 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 OATP04181 439 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 ATP2B1P20020 1258 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.373e-17■□□□□ 9.4
ACTB-211ENST00000480301 KLRC1P26715 233 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 SPIRE1Q08AE8 756 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 MGAT3Q09327 533 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 CUL4AQ13619 759 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 RSPH3Q86UC2 560 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 SLFN12Q8IYM2 578 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 FAM167AQ96KS9 214 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa23.58■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 STBD1O95210 358 aa23.58■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 PRKCEQ02156 737 aa23.58■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 CALCRLQ16602 461 aa23.58■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 MTMR9Q96QG7 549 aa23.58■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 NRBP2Q9NSY0 501 aa23.58■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 NEMFO60524 1076 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 BAIAP3O94812 1187 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 C22orf31O95567 290 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 BANK1Q8NDB2 785 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 DBF4BQ8NFT6 615 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 TMEM60Q9H2L4 133 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 MCM7P33993 719 aa23.56■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 EPHA7Q15375 998 aa23.56■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 CEP131Q9UPN4 1083 aa23.56■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 SLC34A2O95436 690 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 PBX2P40425 430 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 PSMC5P62195 406 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 ZNF174Q15697 407 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 XKR3Q5GH77 459 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 Q7L0L9 218 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 NME8Q8N427 588 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 PBX4Q9BYU1 374 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 PCDHA12Q9UN75 941 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 CDY2AQ9Y6F7 541 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 P4HBP07237 508 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 TXKP42681 527 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 TRAPPC10P48553 1259 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 WDR5P61964 334 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 TMEM62Q0P6H9 643 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 TTC38Q5R3I4 469 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 WDR81Q562E7 1941 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTB-211ENST00000480301 MAGEB2O15479 319 aa23.53■■□□□ 1.36
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