RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ATG4B-216ENST00000475195 TUBE1Q9UJT0 475 aa18.59■□□□□ 0.57
ATG4B-216ENST00000475195 TRPC6Q9Y210 931 aa18.59■□□□□ 0.57
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ATG4B-216ENST00000475195 FAM167AQ96KS9 214 aa18.56■□□□□ 0.56
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ATG4B-216ENST00000475195 KIF3AQ9Y496 699 aa18.56■□□□□ 0.56
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ATG4B-216ENST00000475195 XKR3Q5GH77 459 aa18.53■□□□□ 0.56
ATG4B-216ENST00000475195 IER5Q5VY09 327 aa18.53■□□□□ 0.56
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ATG4B-216ENST00000475195 LINC01465Q8N7H1 131 aa18.52■□□□□ 0.56
ATG4B-216ENST00000475195 SLC9A7Q96T83 725 aa18.52■□□□□ 0.56
ATG4B-216ENST00000475195 PBX4Q9BYU1 374 aa18.52■□□□□ 0.56
ATG4B-216ENST00000475195 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
ATG4B-216ENST00000475195 SMC3Q9UQE7 1217 aa18.52■□□□□ 0.56
ATG4B-216ENST00000475195 EVPLQ92817 2033 aa18.51■□□□□ 0.55
ATG4B-216ENST00000475195 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
ATG4B-216ENST00000475195 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
ATG4B-216ENST00000475195 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
ATG4B-216ENST00000475195 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
ATG4B-216ENST00000475195 C4orf32Q8N8J7 132 aa18.51■□□□□ 0.55
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