RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZBTB42B2RXF5 422 aa24.84■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 KIF28PB7ZC32 967 aa24.84■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF862O60290 1169 aa24.84■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 CXCL10P02778 98 aa24.84■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 GJB2P29033 226 aa24.84■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 PPP2R5CQ13362 524 aa24.84■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 CUL4AQ13619 759 aa24.84■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 UGCGQ16739 394 aa24.84■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 MIER3Q7Z3K6 550 aa24.84■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 KIF3AQ9Y496 699 aa24.84■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 RSPH10B2B2RC85 870 aa24.83■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 EML1O00423 815 aa24.83■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 RSPH10BP0C881 870 aa24.83■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM26DQ5JW98 314 aa24.83■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
IGHV3-20-201ENST00000390606 WDR81Q562E7 1941 aa24.82■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 COL1A2P08123 1366 aa24.82■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 CTSHP09668 335 aa24.82■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP24.82■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF484Q5JVG2 852 aa24.82■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 NOSTRINQ8IVI9 506 aa24.82■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 CKAP2LQ8IYA6 745 aa24.82■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa24.82■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPIRE1Q08AE8 756 aa24.81■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 TCTN1Q2MV58 587 aa24.81■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 MTHFD1LQ6UB35 978 aa24.81■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLFN12Q8IYM2 578 aa24.81■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 DNAJB3Q8WWF6 145 aa24.81■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM167AQ96KS9 214 aa24.81■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 OSBPL7Q9BZF2 842 aa24.81■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 SMC3Q9UQE7 1217 aa24.81■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 NEMFO60524 1076 aa24.8■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 CHRNA1P02708 482 aa24.8■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 ATP2B1P20020 1258 aa24.8■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 KLRC1P26715 233 aa24.8■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 PRKCEQ02156 737 aa24.8■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 CALCRLQ16602 461 aa24.8■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 GPR153Q6NV75 609 aa24.8■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 MTMR9Q96QG7 549 aa24.8■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM60Q9H2L4 133 aa24.8■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 MARCH6O60337 910 aa24.79■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 STBD1O95210 358 aa24.79■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 BAG4O95429 457 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 OATP04181 439 aa24.79■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 ACTN1P12814 892 aa24.79■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 MGAT3Q09327 533 aa24.79■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa24.78■■□□□ 1.56
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IGHV3-20-201ENST00000390606 C22orf31O95567 290 aa24.78■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 MCM7P33993 719 aa24.78■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 CNKSR3Q6P9H4 555 aa24.78■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 RSPH3Q86UC2 560 aa24.78■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
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IGHV3-20-201ENST00000390606 TRAPPC10P48553 1259 aa24.77■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 EPHA7Q15375 998 aa24.77■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF174Q15697 407 aa24.77■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 BANK1Q8NDB2 785 aa24.77■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 NRBP2Q9NSY0 501 aa24.77■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 CEP131Q9UPN4 1083 aa24.77■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa24.77■■□□□ 1.56
IGHV3-20-201ENST00000390606 BAIAP3O94812 1187 aa24.76■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 PSMC5P62195 406 aa24.76■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa24.76■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 XKR3Q5GH77 459 aa24.76■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 TTC38Q5R3I4 469 aa24.76■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 DBF4BQ8NFT6 615 aa24.76■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCDHA12Q9UN75 941 aa24.76■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 CDY2AQ9Y6F7 541 aa24.76■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 TXKP42681 527 aa24.75■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 NCAPH2Q6IBW4 605 aa24.75■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa24.75■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 SNX21Q969T3 373 aa24.75■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 CEP89Q96ST8 783 aa24.75■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa24.74■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 H3BQV1 296 aa24.74■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 P4HBP07237 508 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 QARSP47897 775 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
IGHV3-20-201ENST00000390606 NBR1Q14596 966 aa24.74■■□□□ 1.55
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