RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 CNTNAP1P78357 1384 aa26.23■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 CXCR5P32302 372 aa26.23■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP26.23■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP4A11Q02928 519 aa26.23■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM83BQ5T0W9 1011 aa26.23■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 ALS2CLQ60I27 953 aa26.23■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 TBC1D5Q92609 795 aa26.23■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa26.23■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa26.23■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 TMOD2Q9NZR1 351 aa26.23■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 RNF14Q9UBS8 474 aa26.23■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 TMX2Q9Y320 296 aa26.23■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 COL4A5P29400 1685 aa26.22■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa26.22■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 EPB41P11171 864 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC7A5Q01650 507 aa26.22■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 HGSNATQ68CP4 663 aa26.22■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 EML1O00423 815 aa26.22■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 IRAK1P51617 712 aa26.22■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa26.22■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.22■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 PSMB7Q99436 277 aa26.22■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 GMLQ99445 158 aa26.22■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 NCK2O43639 380 aa26.21■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 GNA14O95837 355 aa26.21■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 RASSF7Q02833 373 aa26.21■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 ADAM9Q13443 819 aa26.21■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 C8orf74Q6P047 294 aa26.21■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC30A10Q6XR72 485 aa26.21■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 SFR1Q86XK3 245 aa26.21■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM151AQ8WW52 585 aa26.21■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 CEP72Q9P209 647 aa26.21■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 HOXD13P35453 343 aa26.2■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF76P36508 570 aa26.2■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 APBA1Q02410 837 aa26.2■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 NNTQ13423 1086 aa26.2■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 BCAS3Q9H6U6 928 aa26.2■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 NLRC4Q9NPP4 1024 aa26.2■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa26.2■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa26.2■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP26.2■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 MYH10P35580 1976 aa26.2■■□□□ 1.79
AMIGO1-201ENST00000369862 RXRBP28702 533 aa26.2■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 EDRF1Q3B7T1 1238 aa26.2■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa26.2■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 CFAP221Q4G0U5 840 aa26.2■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa26.2■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 PPM1EQ8WY54 764 aa26.2■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 WDR18Q9BV38 432 aa26.2■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 CAPS2Q9BXY5 557 aa26.2■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM107BQ9H098 131 aa26.2■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 RGL1Q9NZL6 768 aa26.2■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 EHD2Q9NZN4 543 aa26.2■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 ATAD5Q96QE3 1844 aa26.19■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 CFBP00751 764 aa26.19■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 VIL1P09327 827 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 DLGAP5Q15398 846 aa26.19■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 BHMT2Q9H2M3 363 aa26.19■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 EFCC1Q9HA90 598 aa26.19■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 RSPH10B2B2RC85 870 aa26.19■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 RSPH10BP0C881 870 aa26.19■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC174Q6PII3 467 aa26.19■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa26.19■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 EFCAB13Q8IY85 973 aa26.19■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 RUSC1Q9BVN2 902 aa26.19■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 VGLL3A8MV65 326 aa26.18■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 TLR2O60603 784 aa26.18■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 HSF2BPO75031 334 aa26.18■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 SERPING1P05155 500 aa26.18■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 SPDYE2Q495Y8 402 aa26.18■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 RUFY1Q96T51 708 aa26.18■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 POLD4Q9HCU8 107 aa26.18■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 GOPCQ9HD26 462 aa26.18■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 BUB1O43683 1085 aa26.18■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 MYBP10242 640 aa26.18■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 NR2F2P24468 414 aa26.18■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 SFMBT2Q5VUG0 894 aa26.18■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 STK24Q9Y6E0 443 aa26.18■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 IFT20Q8IY31 132 aa26.17■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 STK32BQ9NY57 414 aa26.17■■□□□ 1.78
AMIGO1-201ENST00000369862 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms