RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 STX1BP61266 288 aa12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 BHMT2Q9H2M3 363 aa12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 CLDN3O15551 220 aa12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 PLCG1P19174 1290 aa12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 EFCAB13Q8IY85 973 aa12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 GINM1Q9NU53 330 aa12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 ZSWIM5Q9P217 1185 aa12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 MGEA5O60502 916 aa12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 H2AFZP0C0S5 128 aa12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 CASP14P31944 242 aa12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 ADD2P35612 726 aa12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 H2AFVQ71UI9 128 aa12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 RAD18Q9NS91 495 aa12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 GABBR1Q9UBS5 961 aa12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 PCSK1NQ9UHG2 260 aa12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM47DPA6NHR8 397 aa12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 INPP5BP32019 993 aa12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 ERICH1Q86X53 443 aa12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 USH1CQ9Y6N9 552 aa12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 OAS2P29728 719 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 TCP11X2Q5H9J9 407 aa12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 FAF2Q96CS3 445 aa12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 WDR11Q9BZH6 1224 aa12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 COA1Q9GZY4 146 aa12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 RNF146Q9NTX7 359 aa12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 KIAA1468Q9P260 1216 aa12.78□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 RNF40O75150 1001 aa12.77□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 TTC4O95801 387 aa12.77□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 GPC3P51654 580 aa12.77□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 PKP1Q13835 747 aa12.77□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 RASGRF1Q13972 1273 aa12.77□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 TTLL4Q14679 1199 aa12.77□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 RBBP7Q16576 425 aa12.77□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 NCLNQ969V3 563 aa12.77□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 SAAL1Q96ER3 474 aa12.77□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 DYDC2Q96IM9 177 aa12.77□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 HOXB7P09629 217 aa12.77□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 PLS3P13797 630 aa12.77□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 PLTPP55058 493 aa12.77□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC10A5Q5PT55 438 aa12.77□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 ADCK2Q7Z695 626 aa12.77□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.36
UBASH3B-201ENST00000284273 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 TRPA1O75762 1119 aa12.77□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 COPB1P53618 953 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF699Q32M78 642 aa12.77□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 C11orf96Q7Z7L8 435 aa12.77□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 TADA2AO75478 443 aa12.77□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 RBL2Q08999 1139 aa12.77□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa12.77□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 ARHGAP24Q8N264 748 aa12.77□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa12.77□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 E5RI56 91 aa12.77□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 H3BRJ5 948 aa12.77□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 CASP1P29466 404 aa12.77□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 LONP1P36776 959 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 MSH2P43246 934 aa12.77□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC7A5Q01650 507 aa12.77□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 BBS9Q3SYG4 887 aa12.77□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 TRIM59Q8IWR1 403 aa12.77□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 LMNTD2Q8IXW0 634 aa12.77□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC17A8Q8NDX2 589 aa12.77□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 CDHR1Q96JP9 859 aa12.77□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 MTMR3Q13615 1198 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 GJB4Q9NTQ9 266 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 SPTLC3Q9NUV7 552 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 PRRG1O14668 218 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 ZBED1O96006 694 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 ASNSP08243 561 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 GNGT1P63211 74 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 POU5F1BQ06416 359 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 IMPG1Q17R60 797 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 SP110Q9HB58 689 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 HYOU1Q9Y4L1 999 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 POTEMA6NI47 508 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 SART1O43290 800 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 SNX2O60749 519 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 OCRLQ01968 901 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 NDUFAF2Q8N183 169 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 HIPK4Q8NE63 616 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 M0QYV0 167 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 ANP32DO95626 131 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 MFSD4BQ5TF39 518 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 PODNQ7Z5L7 613 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 C11orf74Q86VG3 221 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 RFWD2Q8NHY2 731 aa12.76□□□□□ -0.37
UBASH3B-201ENST00000284273 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.4 ms