RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027157.9

Rpe-201, Transcript of Ribulose-phosphate 3-epimerase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rpe, Length 2,692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe-201ENSMUST00000027157 Rbm46P86049 533 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Zc3h18Q0P678 948 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Fdxacb1Q3UY23 622 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Fndc3bQ6NWW9 1207 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Dusp4Q8BFV3 398 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Btnl9Q8BJE2 536 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Osbpl2Q8BX94 484 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Pnma1Q8C1C8 353 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Syne4Q8CII8 388 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Ero1bQ8R2E9 467 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Rassf3Q99P51 232 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Ngly1Q9JI78 651 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Extl3Q9WVL6 918 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Megf6Q80V70 1572 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 1700016G14RikA0A286YCZ6 238 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Myo1aO88329 1043 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Krt86P97861 486 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Ankrd13cQ3UX43 541 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Taf3Q5HZG4 932 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Rsad1Q5SUV1 442 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Ctdp1Q7TSG2 960 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Tbc1d22bQ80VE5 505 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Taf1Q80UV9 1891 aa14.6□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Gcnt4E9Q649 455 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Actn4P57780 912 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Taf1bP97358 586 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 RragaQ80X95 313 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Cracr2bQ80ZJ8 394 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Znf445Q8R2V3 986 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 IrgqQ8VIM9 583 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Ranbp17Q99NF8 1088 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Rwdd2aQ9D9S3 292 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Sema4dO09126 861 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Kcnh2O35219 1162 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Cetn3O35648 167 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Magea8O89012 320 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 AgtP11859 477 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Gse1Q3U3C9 1213 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Ddx10Q80Y44 875 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 MtrrQ8C1A3 696 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Ribc1Q9D0B8 379 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Prg3Q9JL95 222 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Scgb2b19J3QM75 112 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Pth1rP41593 591 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Sec31aQ3UPL0 1230 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 P4ha1Q60715 534 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Xpnpep1Q6P1B1 623 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Etf1Q8BWY3 437 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Cd209bQ8CJ91 325 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Gtf2a1Q99PM3 378 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Adgrf4Q9D2L6 698 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Klhl40Q9D783 621 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Sucla2Q9Z2I9 463 aa14.59□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Ccdc191J3QQ27 883 aa14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Apba3O88888 571 aa14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Kcna2P63141 499 aa14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Nlrp4cQ3TKR3 982 aa14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Raver2Q7TPD6 673 aa14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Scyl2Q8CFE4 930 aa14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Spdl1Q923A2 608 aa14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Fam111aQ9D2L9 613 aa14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Plagl1Q9JLQ4 704 aa14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Plcg1Q62077 1302 aa14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Myh9Q8VDD5 1960 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Pgap3A2A559 320 aa14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 SfnO70456 248 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Fgd3O88842 733 aa14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Mcm5P49718 733 aa14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Cct6aP80317 531 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 E2f8Q58FA4 860 aa14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Znf652Q5DU09 608 aa14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Tpm4Q6IRU2 248 aa14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Mindy1Q76LS9 468 aa14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Nsun6Q7TS68 476 aa14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Nipa1Q8BHK1 323 aa14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Spata4Q8K3V1 295 aa14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Grpel1Q99LP6 217 aa14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Cmtr1Q9DBC3 837 aa14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Map3k20Q9ESL4 802 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Brca1P48754 1812 aa14.58□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Lrrc38A2VDH3 298 aa14.57□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Rexo5D3YW29 759 aa14.57□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Cyth3O08967 399 aa14.57□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Axin2O88566 840 aa14.57□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 PklrP53657 574 aa14.57□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Hmgcs2P54869 508 aa14.57□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Paxbp1P58501 919 aa14.57□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Actr2P61161 394 aa14.57□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Kcnd1Q03719 651 aa14.57□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 OsbpQ3B7Z2 805 aa14.57□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Tcerg1lQ3B807 590 aa14.57□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Gm10392Q3V3I3 114 aa14.57□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Hdac10Q6P3E7 666 aa14.57□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Tube1Q9D6T1 475 aa14.57□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Dnajc7Q9QYI3 494 aa14.57□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Ap1b1O35643 943 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 ByslO54825 436 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Psmc5P62196 406 aa14.57□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Acot6Q32Q92 419 aa14.57□□□□□ -0.08
Rpe-201ENSMUST00000027157 Haus4Q8BFT2 363 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.1 ms