Protein–RNA interactions for Protein: O35648

Cetn3, Centrin-3, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cetn3O35648 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39,88■■■■□ 3,97
Cetn3O35648 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,55■■■■□ 3,6
Cetn3O35648 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36,57■■■■□ 3,44
Cetn3O35648 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,54■■■■□ 3,44
Cetn3O35648 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,31■■■■□ 3,4
Cetn3O35648 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Cetn3O35648 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35,47■■■■□ 3,27
Cetn3O35648 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Cetn3O35648 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,91■■■■□ 3,18
Cetn3O35648 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34,78■■■■□ 3,16
Cetn3O35648 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Cetn3O35648 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,26■■■■□ 3,08
Cetn3O35648 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,22■■■■□ 3,07
Cetn3O35648 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Cetn3O35648 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Cetn3O35648 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Cetn3O35648 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Cetn3O35648 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Cetn3O35648 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Cetn3O35648 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Cetn3O35648 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,95
Cetn3O35648 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Cetn3O35648 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Cetn3O35648 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,41■■■□□ 2,94
Cetn3O35648 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Cetn3O35648 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Cetn3O35648 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,3■■■□□ 2,92
Cetn3O35648 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Cetn3O35648 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Cetn3O35648 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Cetn3O35648 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Cetn3O35648 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Cetn3O35648 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,97■■■□□ 2,87
Cetn3O35648 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Cetn3O35648 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Cetn3O35648 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,82
Cetn3O35648 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32,64■■■□□ 2,82
Cetn3O35648 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32,59■■■□□ 2,81
Cetn3O35648 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Cetn3O35648 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Cetn3O35648 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Cetn3O35648 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,4■■■□□ 2,78
Cetn3O35648 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Cetn3O35648 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,14■■■□□ 2,74
Cetn3O35648 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32,1■■■□□ 2,73
Cetn3O35648 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Cetn3O35648 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Cetn3O35648 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Cetn3O35648 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Cetn3O35648 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,8■■■□□ 2,68
Cetn3O35648 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Cetn3O35648 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Cetn3O35648 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31,65■■■□□ 2,66
Cetn3O35648 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Cetn3O35648 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Cetn3O35648 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Cetn3O35648 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Cetn3O35648 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,43■■■□□ 2,62
Cetn3O35648 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Cetn3O35648 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Cetn3O35648 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,32■■■□□ 2,6
Cetn3O35648 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Cetn3O35648 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,31■■■□□ 2,6
Cetn3O35648 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Cetn3O35648 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,28■■■□□ 2,6
Cetn3O35648 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31,27■■■□□ 2,6
Cetn3O35648 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,26■■■□□ 2,6
Cetn3O35648 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,21■■■□□ 2,59
Cetn3O35648 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,19■■■□□ 2,58
Cetn3O35648 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31,19■■■□□ 2,58
Cetn3O35648 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Cetn3O35648 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Cetn3O35648 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Cetn3O35648 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Cetn3O35648 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Cetn3O35648 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30,96■■■□□ 2,55
Cetn3O35648 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Cetn3O35648 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Cetn3O35648 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Cetn3O35648 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,78■■■□□ 2,52
Cetn3O35648 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,76■■■□□ 2,52
Cetn3O35648 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Cetn3O35648 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Cetn3O35648 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Cetn3O35648 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Cetn3O35648 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Cetn3O35648 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Cetn3O35648 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,49
Cetn3O35648 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,56■■■□□ 2,48
Cetn3O35648 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Cetn3O35648 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Cetn3O35648 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,48
Cetn3O35648 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Cetn3O35648 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Cetn3O35648 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Cetn3O35648 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Cetn3O35648 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,4■■■□□ 2,46
Cetn3O35648 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Cetn3O35648 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Cetn3O35648 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,36■■■□□ 2,45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,7 ms