RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Recql4Q75NR7 1216 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Plcg2Q8CIH5 1265 aa28.69■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ubiad1Q9DC60 336 aa28.69■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sh2b2Q9JID9 621 aa28.69■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Scgb2b12S4R2L0 112 aa28.69■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Il27raO70394 623 aa28.68■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CnpP16330 420 aa28.68■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ddx3xQ62167 662 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 IarsQ8BU30 1262 aa28.68■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trim47Q8C0E3 641 aa28.68■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Borcs6Q9D6W8 360 aa28.68■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Q9DAQ4 598 aa28.68■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Col2a1P28481 1487 aa28.68■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 SynrgQ5SV85 1306 aa28.68■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trim30cD3YVI9 513 aa28.68■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ChkbO55229 394 aa28.68■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 YdjcQ14BV6 310 aa28.68■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Brd2Q7JJ13 798 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Acad11Q80XL6 779 aa28.68■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 TxlnbQ8VBT1 685 aa28.68■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Klhdc7aA2APT9 773 aa28.67■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Wee1P47810 646 aa28.67■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atp13a4Q5XF90 1193 aa28.67■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sycp1Q62209 993 aa28.67■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CrygnQ8VHL5 183 aa28.67■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rpl13P47963 211 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tbc1d10cQ8C9V1 444 aa28.67■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Klf15Q9EPW2 415 aa28.67■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Polr2fP61219 127 aa28.66■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prr7Q3V0I2 269 aa28.66■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cacna2d4Q5RJF7 1116 aa28.66■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atp13a3Q5XF89 1219 aa28.66■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Klhl7Q8BUL5 586 aa28.66■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmem132aQ922P8 1018 aa28.66■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hyou1Q9JKR6 999 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dnajb6O54946 365 aa28.66■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cypt2Q6P924 180 aa28.66■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 SucoQ8C341 1250 aa28.66■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bst2Q8R2Q8 172 aa28.66■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam111aQ9D2L9 613 aa28.66■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm8298J3QPI0 401 aa28.65■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pja1O55176 578 aa28.65■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Xirp1O70373 1129 aa28.65■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ogfod1Q3U0K8 545 aa28.65■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ppp1r7Q3UM45 361 aa28.65■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krt35Q497I4 455 aa28.65■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ift20Q61025 132 aa28.65■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prdm4Q80V63 803 aa28.65■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trim6Q8BGE7 488 aa28.65■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PpanQ91YU8 470 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 StrcQ8VIM6 1809 aa28.65■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rps6ka1P18653 724 aa28.65■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bbof1Q3V079 533 aa28.65■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sco1Q5SUC9 284 aa28.65■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ublcp1Q8BGR9 318 aa28.65■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arl2bpQ9D385 163 aa28.65■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lypla2Q9WTL7 231 aa28.65■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sned1Q70E20 1403 aa28.64■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 FechP22315 420 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc51bQ80WK2 128 aa28.64■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gfpt2Q9Z2Z9 682 aa28.64■■■□□ 2.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm42641I6L9G2 585 aa28.64■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 D1Pas1P16381 660 aa28.64■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Asap3Q5U464 904 aa28.64■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kif5bQ61768 963 aa28.64■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ppm1eQ80TL0 749 aa28.64■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AtripQ8BMG1 785 aa28.64■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Usp38Q8BW70 1042 aa28.64■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bzw2Q91VK1 419 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ace3D0G895 737 aa28.63■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 KaznQ69ZS8 779 aa28.63■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Appl2Q8K3G9 662 aa28.63■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc25a38Q91XD8 326 aa28.63■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf354cQ571J5 560 aa28.63■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sh3gl2Q62420 352 aa28.63■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zhx2Q8C0C0 836 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dph6Q9CQ28 267 aa28.63■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Parp2O88554 559 aa28.62■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Npr3P70180 536 aa28.62■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Surf6P70279 355 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Specc1Q5SXY1 1067 aa28.62■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 IgflQ6B9Z0 140 aa28.62■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PdxkQ8K183 312 aa28.62■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lrrc38A2VDH3 298 aa28.62■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mroh9G5E8L9 891 aa28.62■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kank3Q9Z1P7 791 aa28.62■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 1700017N19RikA0A087WPJ1 469 aa28.61■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lmnb2P21619 596 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AdkP55264 361 aa28.61■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Acsbg2Q2XU92 667 aa28.61■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm5935Q497S0 212 aa28.61■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gas7Q60780 421 aa28.61■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc181Q80ZU5 509 aa28.61■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rufy1Q8BIJ7 712 aa28.61■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cbwd1Q8VEH6 393 aa28.61■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tdrd3Q91W18 743 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Calml4Q91WQ9 153 aa28.61■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mrpl11Q9CQF0 192 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 LrmdaQ9D9B4 229 aa28.61■■■□□ 2.17
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ttc6G3UYY4 1857 aa28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.5 ms