Protein–RNA interactions for Protein: Q91WQ9

Calml4, Calmodulin-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calml4Q91WQ9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38,01■■■■□ 3,68
Calml4Q91WQ9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,02■■■■□ 3,52
Calml4Q91WQ9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Calml4Q91WQ9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,78■■■■□ 3,32
Calml4Q91WQ9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Calml4Q91WQ9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,52■■■■□ 3,12
Calml4Q91WQ9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
Calml4Q91WQ9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Calml4Q91WQ9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,08■■■■□ 3,05
Calml4Q91WQ9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Calml4Q91WQ9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Calml4Q91WQ9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33,41■■■□□ 2,94
Calml4Q91WQ9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Calml4Q91WQ9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33,35■■■□□ 2,93
Calml4Q91WQ9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Calml4Q91WQ9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Calml4Q91WQ9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Calml4Q91WQ9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Calml4Q91WQ9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Calml4Q91WQ9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Calml4Q91WQ9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,52■■■□□ 2,8
Calml4Q91WQ9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Calml4Q91WQ9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Calml4Q91WQ9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Calml4Q91WQ9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Calml4Q91WQ9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Calml4Q91WQ9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Calml4Q91WQ9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,4■■■□□ 2,78
Calml4Q91WQ9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,19■■■□□ 2,74
Calml4Q91WQ9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Calml4Q91WQ9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Calml4Q91WQ9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Calml4Q91WQ9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Calml4Q91WQ9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Calml4Q91WQ9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,91■■■□□ 2,7
Calml4Q91WQ9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Calml4Q91WQ9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Calml4Q91WQ9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Calml4Q91WQ9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Calml4Q91WQ9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Calml4Q91WQ9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,67■■■□□ 2,66
Calml4Q91WQ9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Calml4Q91WQ9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,66■■■□□ 2,66
Calml4Q91WQ9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,59■■■□□ 2,65
Calml4Q91WQ9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,58■■■□□ 2,65
Calml4Q91WQ9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Calml4Q91WQ9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Calml4Q91WQ9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Calml4Q91WQ9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,29■■■□□ 2,6
Calml4Q91WQ9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31,29■■■□□ 2,6
Calml4Q91WQ9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Calml4Q91WQ9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Calml4Q91WQ9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,82■■■□□ 2,52
Calml4Q91WQ9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Calml4Q91WQ9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,76■■■□□ 2,51
Calml4Q91WQ9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Calml4Q91WQ9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Calml4Q91WQ9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Calml4Q91WQ9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Calml4Q91WQ9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,54■■■□□ 2,48
Calml4Q91WQ9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Calml4Q91WQ9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,48
Calml4Q91WQ9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Calml4Q91WQ9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Calml4Q91WQ9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Calml4Q91WQ9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,39■■■□□ 2,46
Calml4Q91WQ9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Calml4Q91WQ9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Calml4Q91WQ9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Calml4Q91WQ9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,29■■■□□ 2,44
Calml4Q91WQ9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Calml4Q91WQ9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Calml4Q91WQ9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Calml4Q91WQ9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Calml4Q91WQ9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Calml4Q91WQ9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Calml4Q91WQ9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Calml4Q91WQ9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Calml4Q91WQ9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30■■■□□ 2,39
Calml4Q91WQ9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Calml4Q91WQ9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Calml4Q91WQ9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Calml4Q91WQ9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Calml4Q91WQ9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Calml4Q91WQ9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Calml4Q91WQ9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Calml4Q91WQ9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Calml4Q91WQ9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Calml4Q91WQ9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Calml4Q91WQ9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Calml4Q91WQ9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Calml4Q91WQ9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,7■■■□□ 2,35
Calml4Q91WQ9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Calml4Q91WQ9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,69■■■□□ 2,34
Calml4Q91WQ9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Calml4Q91WQ9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Calml4Q91WQ9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Calml4Q91WQ9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Calml4Q91WQ9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Calml4Q91WQ9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6,8 ms