RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W YPL034WQ03083 165 aa9.82□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W YLR346CQ06139 101 aa9.82□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W PST1Q12355 444 aa9.82□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W LPX1Q12405 387 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W PEX11Q12462 236 aa9.82□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W MTR10Q99189 972 aa9.82□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W YEL009C-AA0A023PZF2 135 aa9.81□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W DSF1P0CX08 502 aa9.81□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W YNR073CP0CX09 502 aa9.81□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W MER1P16523 270 aa9.81□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W FUB1P25659 250 aa9.81□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W YPT7P32939 208 aa9.81□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W SPO23P33757 523 aa9.81□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W LST4P34239 828 aa9.81□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W YPT52P36018 234 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W YHR035WP38769 630 aa9.81□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W RRP4P38792 359 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W TVP23P38962 199 aa9.81□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W NDE1P40215 560 aa9.81□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W RPS12P48589 143 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W YSA1Q01976 231 aa9.81□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W RRP45Q05636 305 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W PDR8Q06149 701 aa9.81□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W SRN2Q99176 213 aa9.81□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W GCN4P03069 281 aa9.8□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W FUM1P08417 488 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W PET9P18239 318 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W DAL81P21657 970 aa9.8□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W RPS1BP23248 255 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W SNC1P31109 117 aa9.8□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W MCM7P38132 845 aa9.8□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W AIM10P39965 576 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W ZRG8P40021 1076 aa9.8□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W YFR018CP43599 363 aa9.8□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W CHA4P43634 648 aa9.8□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W NNF1P47149 201 aa9.8□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W MUP1P50276 574 aa9.8□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W UBC12P52491 188 aa9.8□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W BUD17P53727 317 aa9.8□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W OAZ1Q02803 292 aa9.8□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W NMD4Q12129 218 aa9.8□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W YHR213W-AQ8TGT4 77 aa9.8□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W HVG1P0CE11 249 aa9.79□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W SLM5P25345 492 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W CAM1P29547 415 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W HOM6P31116 359 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W SEC61P32915 480 aa9.79□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W TEF4P36008 412 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W TAT1P38085 619 aa9.79□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W LSM12P38828 187 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W SSN3P39073 555 aa9.79□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W HPA3P39979 161 aa9.79□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W TIM54P47045 478 aa9.79□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W MDM34P53083 459 aa9.79□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W ERV29P53337 310 aa9.79□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W GIP3Q03016 1276 aa9.79□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W YLR224WQ05947 369 aa9.79□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W BUR2Q05949 395 aa9.79□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W YPL066WQ12194 479 aa9.79□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W YPR011CQ12251 326 aa9.79□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W SKM1Q12469 655 aa9.79□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W PDR3P33200 976 aa9.78□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W LHP1P33399 275 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W MSN2P33748 704 aa9.78□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W PMT1P33775 817 aa9.78□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W RCY1P39531 840 aa9.78□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W PTI1P39927 425 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W RTT105P40063 208 aa9.78□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W IMO32P53219 342 aa9.78□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W COQ6P53318 479 aa9.78□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W YPL068CQ02749 293 aa9.78□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W SCS7Q03529 384 aa9.78□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W RIM13Q03792 727 aa9.78□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W ARV1Q06541 321 aa9.78□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W TGL5Q12043 749 aa9.78□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W ATP14Q12349 124 aa9.78□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W YBR085C-AO43137 85 aa9.77□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W SIR2P06700 562 aa9.77□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W PEP4P07267 405 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W SWI5P08153 709 aa9.77□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W LYP1P32487 611 aa9.77□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W PET127P32606 800 aa9.77□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W SUR1P33300 382 aa9.77□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W APT2P36973 181 aa9.77□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W BSD2P38356 321 aa9.77□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data9.77□□□□□ -0.84not detected
PRP4YPR178W RRF1P38771 230 aa9.77□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W EXG2P52911 562 aa9.77□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W YGR015CP53208 328 aa9.77□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W POP6P53218 158 aa9.77□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W BUD9P53226 547 aa9.77□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W HXT11P54862 567 aa9.77□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W YDR249CQ03787 373 aa9.77□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W YMR130WQ04223 302 aa9.77□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W VID22Q05934 901 aa9.77□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W YPR114WQ06107 315 aa9.77□□□□□ -0.84
PRP4YPR178W PUS5Q06244 254 aa9.77□□□□□ -0.84
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