RNA–Protein interactions for RNA: YML038C

YMD8, Transcript of Putative nucleotide sugar transporter, yeast

Gene YMD8, Length 1,329 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMD8	YML038C	HIS5	P07172	385 aa		5	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	SPS4	P09937	338 aa		5	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	RHB1	P25378	209 aa		5	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	YCR015C	P25616	317 aa		5	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	YPS1	P32329	569 aa		5	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	GSH1	P32477	678 aa		5	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	AST1	P35183	429 aa		5	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	EHT1	P38295	451 aa		5	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	5	□□□□□ -1.61	RIP-Chip
YMD8	YML038C	VAB2	P40003	282 aa		5	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	CHA4	P43634	648 aa		5	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	AMA1	P50082	593 aa		5	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	SLI1	P53304	468 aa		5	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	5	□□□□□ -1.61	not detected
YMD8	YML038C	OCA2	P53949	197 aa		5	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	PAM18	Q07914	168 aa		5	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	RAX1	Q08760	435 aa		5	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	DAP1	Q12091	152 aa		5	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	VAM3	Q12241	283 aa		5	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	INP53	Q12271	1107 aa		5	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	MAS1	P10507	462 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	MRP13	P12686	339 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	TUP1	P16649	713 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	SNF6	P18888	332 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	MNN2	P38069	597 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	MMS21	P38632	267 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	YHR210C	P38893	341 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	ALP1	P38971	573 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	PLB1	P39105	664 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	FHL1	P39521	936 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	BUR6	P40096	142 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	PIG2	P40187	538 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	ROG1	P53118	685 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	YAT1	P80235	687 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	MRS2	Q01926	470 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	STD1	Q02794	444 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	MRP51	Q02950	344 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	HOF1	Q05080	669 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	IPK1	Q06667	281 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	MCM21	Q06675	368 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	YOR012W	Q12351	137 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	RAD1	P06777	1100 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	WHI2	P12611	486 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	CBF1	P17106	351 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	HXT2	P23585	541 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	PSO2	P30620	661 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	FRE1	P32791	686 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	EMP70	P32802	667 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	REC114	P32841	428 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	DOA1	P36037	715 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	NDC80	P40460	691 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	HXT9	P40885	567 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	FAR3	P46671	204 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	RFX1	P48743	811 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	COS12	P53053	380 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	YGL159W	P53110	370 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	HXT11	P54862	567 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	YDR222W	Q04925	415 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	CDD1	Q06549	142 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	REX4	Q08237	289 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
YMD8	YML038C	YOR029W	Q12243	111 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	SPO24	Q3E752	67 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	GSC2	P40989	1895 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	PUT2	P07275	575 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	ALG1	P16661	449 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	STE18	P18852	110 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	ADE1	P27616	306 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	PEX3	P28795	441 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	DSS4	P32601	143 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	YBR144C	P34215	104 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	LST4	P34239	828 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	LDB7	P38210	180 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	YER130C	P39959	443 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	RIP-Chip
YMD8	YML038C	MSE1	P48525	536 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMD8	YML038C	RRN9	P53437	365 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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