RNA–Protein interactions for RNA: YJR104C

SOD1, Transcript of Cytosolic copper-zinc superoxide dismutase, yeast

Gene SOD1, Length 465 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOD1	YJR104C	GPI1	P53306	609 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	CPR8	P53728	308 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.4	□□□□□ -1.87	not detected
SOD1	YJR104C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	NEJ1	Q06148	342 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	IMA2	Q08295	589 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YPL272C	Q08984	517 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	AKR2	Q12013	749 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	REX3	Q12090	404 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	TRM10	Q12400	293 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YOR019W	Q99248	730 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	STE2	D6VTK4	431 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	GCN4	P03069	281 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	REP2	P03872	296 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	TPK1	P06244	397 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	CCA1	P21269	546 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PPH22	P23595	377 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MGR1	P25573	417 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	NGG1	P32494	702 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SFA1	P32771	386 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ELF1	P36053	145 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PET10	P36139	283 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MRPL37	P36532	105 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RIM2	P38127	377 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	COS8	P38723	381 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ARN2	P38724	620 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	BZZ1	P38822	633 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	LYS9	P38999	446 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	BIO3	P50277	480 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	DOC1	P53068	250 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	POP6	P53218	158 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	IMO32	P53219	342 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PEX8	P53248	589 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	CLD1	P53264	445 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	LSB1	P53281	241 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RSM27	P53305	110 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SPC98	P53540	846 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ALG12	P53730	551 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YNR062C	P53748	327 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YNL146W	P53906	100 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YNL095C	P53932	642 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YNL092W	P53934	400 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ARK1	P53974	638 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	HXT11	P54862	567 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SMA1	Q02651	245 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PEX25	Q02969	394 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	AIM36	Q03798	255 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	CIA1	Q05583	330 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YDR278C	Q05612	105 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YLR283W	Q05867	314 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ARO10	Q06408	635 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YFT2	Q06676	274 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ASR1	Q06834	288 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YET3	Q07451	203 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YDL086W	Q07505	273 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	THI72	Q08579	599 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	TCO89	Q08921	799 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	NSL1	Q12143	216 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	HAL9	Q12180	1030 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RAD7	P06779	565 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	COS2	P0CX12	379 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	COS3	P0CX13	379 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ENA1	P13587	1091 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	CHS2	P14180	963 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	AMD2	P22580	549 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	TRK2	P28584	889 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	FUN26	P31381	517 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	NDI1	P32340	513 aa		3.38	□□□□□ -1.87

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