RNA–Protein interactions for RNA: YGR058W

PEF1, Transcript of Penta-EF-hand protein, yeast

Gene PEF1, Length 1,008 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEF1	YGR058W	VTC2	P43585	828 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	SHY1	P53266	389 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	HER2	Q03557	464 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	AIM33	Q04516	312 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	CSM3	Q04659	317 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	FUS2	Q05670	677 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	MUM3	Q08750	479 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	ITR1	P30605	584 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	AFG1	P32317	509 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	YBR137W	P38276	179 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	RMD8	P43620	662 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	LIF1	P53150	421 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	TWF1	P53250	332 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	YMR027W	Q04371	470 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	SPH1	Q06160	661 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	YPR022C	Q12139	1133 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	SMC6	Q12749	1114 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	RHO2	P06781	192 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	OCA4	P25366	362 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	VAB2	P40003	282 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	SSN8	P47821	323 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	YGR149W	P48236	432 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	YLH47	Q06493	454 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	FDH1	Q08911	376 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	TRP1	P00912	224 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	PHO13	P19881	312 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	PSO2	P30620	661 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	SEC66	P33754	206 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	PMT1	P33775	817 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	YET1	P35723	206 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	SIP3	P38717	1229 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	PGA2	P53903	129 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	TIM10	P87108	93 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	PPM1	Q04081	328 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	TSA2	Q04120	196 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	YOL075C	Q08234	1294 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	ATG29	Q12092	213 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	PCL1	P24867	279 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	RAD14	P28519	371 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	ECM25	P32525	599 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	GYP6	P32806	458 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	MNS1	P32906	549 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	CMC1	P36064	111 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	UTH1	P36135	365 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	CTM1	P38818	585 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	MTM1	P53320	366 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	YDR387C	Q04162	555 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	COG4	Q06096	861 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	TIM18	Q08749	192 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	ERP3	Q12403	225 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	ECM29	P38737	1868 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	NFT1	P0CE68	1218 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	OM45	P16547	393 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	SLY1	P22213	666 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	REC114	P32841	428 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	NIP100	P33420	868 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	FIS1	P40515	155 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	HXT14	P42833	540 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	TOS3	P43637	560 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	DSL1	P53847	754 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	ALF1	P53904	254 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	HAL1	Q01766	294 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	RSN1	Q03516	953 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	CUR1	Q06469	252 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	YDL012C	Q12489	107 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	RPC53	P25441	422 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	GPI10	P30777	616 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	RPC25	P35718	212 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	TVP38	P36164	337 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	PCH2	P38126	564 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	SPT8	P38915	602 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	MET18	P40469	1032 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PEF1	YGR058W	PEX25	Q02969	394 aa		3.09	□□□□□ -1.91

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