RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617649.4

ACACA-240, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

TSL 5 BASIC

Gene ACACA, Length 7,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-240	ENST00000617649	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	CLIC4	Q9Y696	253 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	PFAS	O15067	1338 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	PRPSAP2	O60256	369 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	PPFIA4	O75335	1185 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	SATB1	Q01826	763 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	THAP9	Q9H5L6	903 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	PTPRU	Q92729	1446 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	7.17	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	CA4	P22748	312 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	SCYL1	Q96KG9	808 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	SPATA33	Q96N06	139 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	HUS1	O60921	280 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	ARHGAP4	P98171	946 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	VCX3B	Q9H321	246 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	KIF28P	B7ZC32	967 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	STK25	O00506	426 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	DDIT3	P35638	169 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	MICALL2	Q8IY33	904 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	SGK1	O00141	431 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	NNMT	P40261	264 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	SEMA3F	Q13275	785 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	UBE2S	Q16763	222 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	KCTD6	Q8NC69	237 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	ZNF653	Q96CK0	615 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	PIDD1	Q9HB75	910 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	SLFN14	P0C7P3	912 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	CETP	P11597	493 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	HSPA6	P17066	643 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	PLCG1	P19174	1290 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	NUF2	Q9BZD4	464 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	RERE	Q9P2R6	1566 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	CLCN1	P35523	988 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	IRX4	P78413	519 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	PROM2	Q8N271	834 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	HAUS8	Q9BT25	410 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	SLC26A4	O43511	780 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	GRM4	Q14833	912 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	ALX1	Q15699	326 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	KAZN	Q674X7	775 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	GANC	Q8TET4	914 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	PAM	P19021	973 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	STAT3	P40763	770 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	AP3M2	P53677	418 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	COG7	P83436	770 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	SPP2	Q13103	211 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ACACA-240	ENST00000617649	ZBBX	A8MT70	800 aa		7.15	□□□□□ -1.26

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