RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	HMGCR	P04035	888 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRMT2	P55345	433 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	PSMC6	P62333	389 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	LAMC2	Q13753	1193 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	UGCG	Q16739	394 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	GPR20	Q99678	358 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATG7	O95352	703 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	PSAP	P07602	524 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	CNGA1	P29973	690 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	AFG1L	Q8WV93	481 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	STAM	Q92783	540 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	TIGD1	Q96MW7	591 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576		E9PMD0	336 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	BACH1	O14867	736 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZBTB39	O15060	712 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	AKR1A1	P14550	325 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	NEK9	Q8TD19	979 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC26A4	O43511	780 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	GRK4	P32298	578 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	AFM	P43652	599 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPTC7	Q8NI37	304 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	MTR	Q99707	1265 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	STK17A	Q9UEE5	414 aa		10.25	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF862	O60290	1169 aa		10.24	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	PSMC5	P62195	406 aa		10.24	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		10.24	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	TLK2	Q86UE8	772 aa		10.24	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRIM50	Q86XT4	487 aa		10.24	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCYT2	Q99447	389 aa		10.24	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNMD	Q9H2S6	317 aa		10.24	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	USP25	Q9UHP3	1055 aa		10.24	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	DNM3	Q9UQ16	869 aa		10.24	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		10.24	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEPT4	O43236	478 aa		10.24	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	LBX1	P52954	281 aa		10.24	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	MCM6	Q14566	821 aa		10.24	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	RAD54L	Q92698	747 aa		10.24	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		10.24	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	PAGE5	Q96GU1	130 aa		10.24	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		10.24	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	INHA	P05111	366 aa		10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	MUT	P22033	750 aa		10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	CASP1	P29466	404 aa		10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	NACC1	Q96RE7	527 aa		10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	CUEDC2	Q9H467	287 aa		10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF302	Q9NR11	478 aa		10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM150B	A6NC51	233 aa		10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLA2G4B	P0C869	781 aa		10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	PNOC	Q13519	176 aa		10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	C4orf19	Q8IY42	314 aa		10.23	□□□□□ -0.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms