RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 ZBED4O75132 1171 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 BMP3P12645 472 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM266Q2M3C6 531 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 TC2NQ8N9U0 490 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 RASSF8Q8NHQ8 419 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 KIFC2Q96AC6 838 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 CTNND2Q9UQB3 1225 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 ZBTB5O15062 677 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 CLK2P49760 499 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 KLHL10Q6JEL2 608 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 CPXCR1Q8N123 301 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 ARRDC4Q8NCT1 418 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 CALML4Q96GE6 196 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC27Q9C0I9 530 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 BLZF1Q9H2G9 400 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 VAT1LQ9HCJ6 419 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 KLRC4O43908 158 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 CASP1P29466 404 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 CNNM4Q6P4Q7 775 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 ADGRF4Q8IZF3 695 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 NELFBQ8WX92 580 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 CUL5Q93034 780 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 GMCL1Q96IK5 515 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 CPVLQ9H3G5 476 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 SZT2Q5T011 3432 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 FECHP22830 423 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 OAZ1P54368 228 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 THAP9Q9H5L6 903 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 TPM1P09493 284 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 RASGRP2Q7LDG7 609 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 PPFIBP1Q86W92 1011 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMA7O14818 248 aa28.33■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 ETF1P62495 437 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 CALCRLQ16602 461 aa28.33■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 CNGA4Q8IV77 575 aa28.33■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD7Q92527 254 aa28.33■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 L2HGDHQ9H9P8 463 aa28.33■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 PLA2G6O60733 806 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 FDX1P10109 184 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 PLCG1P19174 1290 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 STX17P56962 302 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 KMT5BQ4FZB7 885 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXR2Q6PJQ5 311 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 STAMQ92783 540 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 GPCPD1Q9NPB8 672 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAH12Q6ZR08 3092 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 BICDL2A1A5D9 508 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 PRCPP42785 496 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 STAT2P52630 851 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC41Q15345 812 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 MOXD1Q6UVY6 613 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC1A4P43007 532 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC96Q2M329 555 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 TCP11X2Q5H9J9 407 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM160B2Q86V87 743 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 CHST13Q8NET6 341 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 CHURC1Q8WUH1 139 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM9Q9C026 710 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 COPB1P53618 953 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 KRT31Q15323 416 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 REXO1L1PQ8IX06 675 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF536O15090 1300 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 PP2D1A8MPX8 630 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 KBTBD13C9JR72 458 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 CDC25AP30304 524 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 FGD4Q96M96 766 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXO40Q9UH90 709 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 LAMA3Q16787 3333 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PQC6 194 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNJ18B7U540 433 aa28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms