RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566279.5

TCF4-231, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-231	ENST00000566279	FDX1	P10109	184 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	CNTN2	Q02246	1040 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	TRAF1	Q13077	416 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	CCL14	Q16627	93 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	PRR16	Q569H4	304 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	P2RX5	Q93086	422 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	HPS3	Q969F9	1004 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	MROH8	Q9H579	483 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	THAP9	Q9H5L6	903 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	ACAD9	Q9H845	621 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	GJD2	Q9UKL4	321 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	TBX3	O15119	743 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	SLC25A27	O95847	323 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	CYP3A4	P08684	503 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	ELN	P15502	786 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	CCNE1	P24864	410 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	GRB14	Q14449	540 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	MORN1	Q5T089	497 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	ASTN1	O14525	1302 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	N4BP3	O15049	544 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	CFB	P00751	764 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	PPP1R2	P41236	205 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	EHHADH	Q08426	723 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	TRIM32	Q13049	653 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	KCTD2	Q14681	263 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	PTPN14	Q15678	1187 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	CEP135	Q66GS9	1140 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	DYM	Q7RTS9	669 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	DDX12P	Q92771	950 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	VPS16	Q9H269	839 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	COL20A1	Q9P218	1284 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	SRRD	Q9UH36	339 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	POTEB3	A0JP26	581 aa		11.27	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	BICDL2	A1A5D9	508 aa		11.27	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	MSH4	O15457	936 aa		11.27	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	ARHGAP6	O43182	974 aa		11.27	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	MED24	O75448	989 aa		11.27	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	RBL2	Q08999	1139 aa		11.27	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		11.27	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	POTEB	Q6S5H4	581 aa		11.27	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		11.27	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	CHST13	Q8NET6	341 aa		11.27	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		11.27	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		11.27	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		11.27	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		11.27	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		11.27	□□□□□ -0.6
TCF4-231	ENST00000566279	ABCB11	O95342	1321 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	STX10	O60499	249 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	POLR2M	P0CAP2	368 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	11.27	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	MAP2K5	Q13163	448 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	DPP9	Q86TI2	863 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	TRIB2	Q92519	343 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	USP6NL	Q92738	828 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	FGD4	Q96M96	766 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	FAM20A	Q96MK3	541 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	PANX2	Q96RD6	677 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	VAV3	Q9UKW4	847 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	MCM3AP	O60318	1980 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TCF4-231	ENST00000566279	LGALS16	A8MUM7	142 aa		11.26	□□□□□ -0.61

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