RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-233ENST00000552688 MUTYHQ9UIF7 546 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 RRN3P2A6NIE6 340 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 MGAT3Q09327 533 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 TROAPQ12815 778 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 COASYQ13057 564 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 PPFIA1Q13136 1202 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 LPIN1Q14693 890 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 FBXO47Q5MNV8 452 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 CASC1Q6TDU7 716 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 TRIM67Q6ZTA4 783 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 CATIPQ7Z7H3 387 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 NPAS4Q8IUM7 802 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 EFHBQ8N7U6 833 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 PBXIP1Q96AQ6 731 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 MAP3K14Q99558 947 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 LZTS2Q9BRK4 669 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 BCAS3Q9H6U6 928 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 TUBE1Q9UJT0 475 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 PTPRSQ13332 1948 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 TMEM221A6NGB7 291 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 LOC730098B7Z3J9 87 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 M0QZ92 97 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 M0R296 226 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 CYTH3O43739 400 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 ST18O60284 1047 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 TBX10O75333 385 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 KIF5BP33176 963 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 GNAQP50148 359 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 NUBP1P53384 320 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 ZXDAP98168 799 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 UBE3AQ05086 875 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 SEMA3FQ13275 785 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 CAMK1Q14012 370 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 CLUL1Q15846 466 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 GRIK4Q16099 956 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 CYB5R4Q7L1T6 521 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 TRIM50Q86XT4 487 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 CRIPAKQ8N1N5 446 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 NME8Q8N427 588 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 SMRP1Q8NCR6 262 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 NCOA7Q8NI08 942 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 SPPL3Q8TCT6 385 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 DNAJB3Q8WWF6 145 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 GLG1Q92896 1179 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 AAASQ9NRG9 546 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 CDY2AQ9Y6F7 541 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 MUC6Q6W4X9 2439 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 PIEZO1Q92508 2521 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 MEIS2O14770 477 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 LINC01565O15544 149 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 ITGB1P05556 798 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 CYP21A2P08686 494 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 KCNA2P16389 499 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 SP4Q02446 784 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 SIGLEC14Q08ET2 396 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 WTAPQ15007 396 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 SLC35G1Q2M3R5 365 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 ODR4Q5SWX8 454 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 MARCH8Q5T0T0 291 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 USP17L6PQ6QN14 398 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 RUFY4Q6ZNE9 571 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 FBXL6Q8N531 539 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 KLHL23Q8NBE8 558 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 SNX27Q96L92 541 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 MTA3Q9BTC8 594 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 SPZ1Q9BXG8 430 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 AZI2Q9H6S1 392 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 CLEC1BQ9P126 229 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 MICAL3Q7RTP6 2002 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 CHD7Q9P2D1 2997 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-233ENST00000552688 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.3 ms