RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 ARHGAP4P98171 946 aa21.16■□□□□ 0.98
PUF60-218ENST00000531995 SP2Q02086 613 aa21.16■□□□□ 0.98
PUF60-218ENST00000531995 TFF2Q03403 129 aa21.16■□□□□ 0.98
PUF60-218ENST00000531995 TAP1Q03518 808 aa21.16■□□□□ 0.98
PUF60-218ENST00000531995 TCTN1Q2MV58 587 aa21.16■□□□□ 0.98
PUF60-218ENST00000531995 WNT8BQ93098 351 aa21.16■□□□□ 0.98
PUF60-218ENST00000531995 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
PUF60-218ENST00000531995 KATNAL1Q9BW62 490 aa21.16■□□□□ 0.98
PUF60-218ENST00000531995 BCAS3Q9H6U6 928 aa21.16■□□□□ 0.98
PUF60-218ENST00000531995 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.16■□□□□ 0.98
PUF60-218ENST00000531995 LCHNA4D1U4 455 aa21.15■□□□□ 0.98
PUF60-218ENST00000531995 FAM205CA6NFA0 338 aa21.15■□□□□ 0.98
PUF60-218ENST00000531995 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa21.15■□□□□ 0.98
PUF60-218ENST00000531995 TLL1O43897 1013 aa21.15■□□□□ 0.98
PUF60-218ENST00000531995 NBNO60934 754 aa21.15■□□□□ 0.98
PUF60-218ENST00000531995 GGPS1O95749 300 aa21.15■□□□□ 0.98
PUF60-218ENST00000531995 CKBP12277 381 aa21.15■□□□□ 0.98
PUF60-218ENST00000531995 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
PUF60-218ENST00000531995 LAMC2Q13753 1193 aa21.15■□□□□ 0.98
PUF60-218ENST00000531995 GPNMBQ14956 572 aa21.15■□□□□ 0.98
PUF60-218ENST00000531995 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa21.15■□□□□ 0.98
PUF60-218ENST00000531995 SPATA33Q96N06 139 aa21.15■□□□□ 0.98
PUF60-218ENST00000531995 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.15■□□□□ 0.98
PUF60-218ENST00000531995 JADE2Q9NQC1 790 aa21.15■□□□□ 0.98
PUF60-218ENST00000531995 NCOR1O75376 2440 aa21.15■□□□□ 0.98
PUF60-218ENST00000531995 FAM86B1E9PN63 330 aa21.14■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 MEIS1O00470 390 aa21.14■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 FAM86B2P0C5J1 330 aa21.14■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 KRT2P35908 639 aa21.14■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.14■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 HSCBQ8IWL3 235 aa21.14■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 TBCKQ8TEA7 893 aa21.14■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 MXRA8Q9BRK3 442 aa21.14■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 MTCH2Q9Y6C9 303 aa21.14■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.13■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 KIF28PB7ZC32 967 aa21.13■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 HAS3O00219 553 aa21.13■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 ATP9AO75110 1047 aa21.13■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 CIITAP33076 1130 aa21.13■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 RBL2Q08999 1139 aa21.13■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 TRIM29Q14134 588 aa21.13■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 HIC1Q14526 733 aa21.13■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 MYSM1Q5VVJ2 828 aa21.13■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 CNKSR3Q6P9H4 555 aa21.13■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 KRT25Q7Z3Z0 450 aa21.13■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.13■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 ARP10275 920 aa21.12■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 USP11P51784 963 aa21.12■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 KCNQ1P51787 676 aa21.12■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 CEP55Q53EZ4 464 aa21.12■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 ZNF618Q5T7W0 954 aa21.12■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 GDPD5Q8WTR4 605 aa21.12■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 GPRASP2Q96D09 838 aa21.12■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 MTUS1Q9ULD2 1270 aa21.12■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 FIBPO43427 364 aa21.11■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 CXCL10P02778 98 aa21.11■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 TGFB3P10600 412 aa21.11■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 PTK7Q13308 1070 aa21.11■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 MBTPS1Q14703 1052 aa21.11■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP21.11■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 INF2Q27J81 1249 aa21.11■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 TRAF7Q6Q0C0 670 aa21.11■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa21.11■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 LENG9Q96B70 501 aa21.11■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 ZBED2Q9BTP6 218 aa21.11■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.11■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa21.1■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 KCNA2P16389 499 aa21.1■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 CYP3A7P24462 503 aa21.1■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 GRB10Q13322 594 aa21.1■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 FAM117BQ6P1L5 589 aa21.1■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 KCNV1Q6PIU1 500 aa21.1■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 NIPA1Q7RTP0 329 aa21.1■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 NLRX1Q86UT6 975 aa21.1■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 MBOAT7Q96N66 472 aa21.1■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 MLXIPQ9HAP2 919 aa21.1■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21.09■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 WNT7AO00755 349 aa21.09■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.09■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 MTMR1Q13613 665 aa21.09■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 GNPTABQ3T906 1256 aa21.09■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 KCNH7Q9NS40 1196 aa21.09■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 MAFGO15525 162 aa21.08■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 TDP2O95551 362 aa21.08■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 LGALS2P05162 132 aa21.08■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 ZNF76P36508 570 aa21.08■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 THPOP40225 353 aa21.08■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 TRIM50Q86XT4 487 aa21.08■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.08■□□□□ 0.97
PUF60-218ENST00000531995 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms