RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 WDR64B1ANS9 1081 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 PITPNM1O00562 1244 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 BACH1O14867 736 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 TBX3O15119 743 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 PSAPP07602 524 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 GNAT1P11488 350 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC26A2P50443 739 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 PTK7Q13308 1070 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 BFSP2Q13515 415 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 POTEDQ86YR6 584 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC155Q8N6L0 562 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 CAGE1Q8TC20 777 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 ATP6V0A1Q93050 837 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM20AQ96MK3 541 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 UNC45AQ9H3U1 944 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF302Q9NR11 478 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 SETD4Q9NVD3 440 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 NRCAMQ92823 1304 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 KIF28PB7ZC32 967 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 WNT7AO00755 349 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC34A2O95436 690 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 SFNP31947 248 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 JAK3P52333 1124 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 ADAM17P78536 824 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 RBL2Q08999 1139 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 PPFIA1Q13136 1202 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.032e-7■□□□□ 10
PACSIN3-208ENST00000531226 PLCB4Q15147 1175 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 B3GNT9Q6UX72 402 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 SERINC5Q86VE9 423 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 LMBR1Q8WVP7 490 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 SNX21Q969T3 373 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 DISC1Q9NRI5 854 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 SAMM50Q9Y512 469 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 TREHO43280 583 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 CHMP2AO43633 222 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 CSF2RAP15509 400 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 CCL23P55773 120 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 GRIK4Q16099 956 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 SWSAP1Q6NVH7 229 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 TDHQ8IZJ6 230 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 RDM1Q8NG50 284 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 HAS1Q92839 578 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 TRPC6Q9Y210 931 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-208ENST00000531226 EPHB4P54760 987 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 PDXDC2PQ6P474 469 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 RETREG2Q8NC44 543 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 WNT8BQ93098 351 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 SCLYQ96I15 445 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 GABBR1Q9UBS5 961 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 VAV3Q9UKW4 847 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 ARID2Q68CP9 1835 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 POTEB3A0JP26 581 aa21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 H3BQV1 296 aa21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 NEMFO60524 1076 aa21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 BAG4O95429 457 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 INSRRP14616 1297 aa21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP2R5CQ13362 524 aa21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 POTEBQ6S5H4 581 aa21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 MIER3Q7Z3K6 550 aa21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 SLFN12Q8IYM2 578 aa21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 ATP8B4Q8TF62 1192 aa21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 RRN3P2A6NIE6 340 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 MARCH6O60337 910 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 HBP1O60381 514 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 IQCF3P0C7M6 154 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 CKBP12277 381 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 ATP2B1P20020 1258 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 ATP4AP20648 1035 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 TRAPPC10P48553 1259 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 CALCRLQ16602 461 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 IL23AQ9NPF7 189 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 TUBE1Q9UJT0 475 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 MYH15Q9Y2K3 1946 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 COL1A2P08123 1366 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 SELPP16109 830 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 MCM7P33993 719 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 RFC2P35250 354 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 MARCH8Q5T0T0 291 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 MCTP1Q6DN14 999 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRC8DQ7L1W4 858 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 HSCBQ8IWL3 235 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-208ENST00000531226 CKAP2LQ8IYA6 745 aa21.42■■□□□ 1.02
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