RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528140.5

MYB-223, Transcript of MYB proto-oncogene, transcription factor, human

TSL 1 (best)

Gene MYB, Length 2,021 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYB-223	ENST00000528140	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	PIK3CD	O00329	1044 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	MEIS2	O14770	477 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	PPFIA4	O75335	1185 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	F2	P00734	622 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	IQCF3	P0C7M6	154 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	RFC2	P35250	354 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	PSEN2	P49810	448 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	ZNF445	P59923	1031 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	KRT32	Q14532	448 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	GRIN2C	Q14957	1233 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	CAGE1	Q8TC20	777 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	VWCE	Q96DN2	955 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	ALG1	Q9BT22	464 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	MSRA	Q9UJ68	235 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	TULP2	O00295	520 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	FIBP	O43427	364 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	SEC24B	O95487	1268 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	ACTN1	P12814	892 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	NEDD9	Q14511	834 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	RAB30	Q15771	203 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	APOA5	Q6Q788	366 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	HAS3	O00219	553 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	ZBTB43	O43298	467 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	ICAM3	P32942	547 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	RABGGTB	P53611	331 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	UBE2S	Q16763	222 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	METTL7B	Q6UX53	244 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	USP26	Q9BXU7	913 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140		H3BRB1	525 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	LILRB3	O75022	631 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	LGALS2	P05162	132 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	CKB	P12277	381 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	SELP	P16109	830 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	NDUFV2	P19404	249 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	VAC14	Q08AM6	782 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	SEMA3F	Q13275	785 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	PTK7	Q13308	1070 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	RTN1	Q16799	776 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	NLRX1	Q86UT6	975 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	DLL1	O00548	723 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	CPA1	P15085	419 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	MYOG	P15173	224 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MYB-223	ENST00000528140	DDIT3	P35638	169 aa		6.62	□□□□□ -1.35

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