RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 CKBP12277 381 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP2-225ENST00000513069 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP17.2■□□□□ 0.342e-6■■□□□ 12.3
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SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM240Q5SV17 173 aa17.2■□□□□ 0.34
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SH3BP2-225ENST00000513069 SWSAP1Q6NVH7 229 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP2-225ENST00000513069 AFAP1L1Q8TED9 768 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP2-225ENST00000513069 LMBR1Q8WVP7 490 aa17.2■□□□□ 0.34
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SH3BP2-225ENST00000513069 IL23AQ9NPF7 189 aa17.2■□□□□ 0.34
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SH3BP2-225ENST00000513069 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP2-225ENST00000513069 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
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SH3BP2-225ENST00000513069 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa17.18■□□□□ 0.34
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SH3BP2-225ENST00000513069 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
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SH3BP2-225ENST00000513069 ZBTB10Q96DT7 871 aa17.18■□□□□ 0.34
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SH3BP2-225ENST00000513069 GNAT1P11488 350 aa17.17■□□□□ 0.34
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SH3BP2-225ENST00000513069 SLC26A2P50443 739 aa17.17■□□□□ 0.34
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SH3BP2-225ENST00000513069 OSBPL7Q9BZF2 842 aa17.17■□□□□ 0.34
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SH3BP2-225ENST00000513069 PSAPP07602 524 aa17.16■□□□□ 0.34
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SH3BP2-225ENST00000513069 POTEBQ6S5H4 581 aa17.16■□□□□ 0.34
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SH3BP2-225ENST00000513069 LRCH3Q96II8 777 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2-225ENST00000513069 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
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SH3BP2-225ENST00000513069 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2-225ENST00000513069 RRN3P2A6NIE6 340 aa17.15■□□□□ 0.34
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SH3BP2-225ENST00000513069 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP17.15■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 30.7
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SH3BP2-225ENST00000513069 RFC2P35250 354 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-225ENST00000513069 THPOP40225 353 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-225ENST00000513069 IGBP1P78318 339 aa17.15■□□□□ 0.34
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SH3BP2-225ENST00000513069 PPP2R5CQ13362 524 aa17.15■□□□□ 0.34
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SH3BP2-225ENST00000513069 FAM160B1Q5W0V3 765 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-225ENST00000513069 DEFB128Q7Z7B8 93 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-225ENST00000513069 RPAINQ86UA6 219 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-225ENST00000513069 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-225ENST00000513069 HERVK_113Q902F9 699 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-225ENST00000513069 MTMR9Q96QG7 549 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-225ENST00000513069 TRPC6Q9Y210 931 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-225ENST00000513069 SAMM50Q9Y512 469 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-225ENST00000513069 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-225ENST00000513069 HBP1O60381 514 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP2-225ENST00000513069 STBD1O95210 358 aa17.14■□□□□ 0.33
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