RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CADM3Q8N126 398 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 MDM1Q8TC05 714 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 MOGAT1Q96PD6 335 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CENPKQ9BS16 269 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PANK4Q9NVE7 773 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 THAP1Q9NVV9 213 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 BCORL1Q5H9F3 1711 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CTAGE15A4D2H0 777 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 SNTNA6NMZ2 147 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 GOLGA8MH3BSY2 632 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 AGPSO00116 658 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 OLFM2O95897 454 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ZBED1O96006 694 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CTAGE8P0CG41 777 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CFL1P23528 166 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CCNFP41002 786 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CBX5P45973 191 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ATP11AP98196 1134 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ATP8B2P98198 1209 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 RUNX1T1Q06455 604 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 WDR44Q5JSH3 913 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 SYCP2LQ5T4T6 812 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CTAGE6Q86UF2 777 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CTAGE4Q8IX94 777 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 C8orf37Q96NL8 207 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 VTA1Q9NP79 307 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 TRIM10Q9UDY6 481 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PRSS47A8MTI9 375 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM114B3SHH9 223 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ENPP3O14638 875 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ATP9AO75110 1047 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 GUCY1B2O75343 617 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 WFS1O76024 890 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 RALGDSQ12967 914 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ANO4Q32M45 955 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ARMC4Q5T2S8 1044 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ARMCX5Q6P1M9 558 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 LONP2Q86WA8 852 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 TREML1Q86YW5 311 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 FAM20AQ96MK3 541 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 OLFM3Q96PB7 478 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 WDR24Q96S15 920 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 HEPHQ9BQS7 1158 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ALG1Q9BT22 464 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 BEGAINQ9BUH8 593 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 STAG3Q9UJ98 1225 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 LMTK2Q8IWU2 1503 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 MACROD2A1Z1Q3 448 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 EXTL3O43909 919 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 NAGAP17050 411 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 HPDP32754 393 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PPP4R3AQ6IN85 833 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 FNDC8Q8TC99 324 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 RSAD2Q8WXG1 361 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CCT6BQ92526 530 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PGBD4Q96DM1 585 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 NRBF2Q96F24 287 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 SAMD11Q96NU1 681 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 LPIN3Q9BQK8 851 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 TTPALQ9BTX7 342 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 DDX19BQ9UMR2 479 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.68□□□□□ -1.34
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