RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	GPC1	P35052	558 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	IKBKE	Q14164	716 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	C7orf31	Q8N865	590 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SKAP2-209	ENST00000497511	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		12.71	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PRU2	124 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC01553	A4QN01	128 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	WFS1	O76024	890 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	GJB5	O95377	273 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	IL9	P15248	144 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	ERVK-21	P61565	698 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPRO	Q16827	1216 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	DNER	Q8NFT8	737 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	AFG1L	Q8WV93	481 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	INCENP	Q9NQS7	918 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	SCN5A	Q14524	2016 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	POM121C	A8CG34	1229 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	GH1	P01241	217 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	MMP3	P08254	477 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	MRE11	P49959	708 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	USH1G	Q495M9	461 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF217	Q8TC41	542 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	ALG1	Q9BT22	464 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM50B	Q9Y247	325 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	12.69	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	MEN1	O00255	615 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	ARIH2	O95376	493 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	AMH	P03971	560 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	CKB	P12277	381 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	EDNRB	P24530	442 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	CLN3	Q13286	438 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	LY6K	Q17RY6	165 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	INSL6	Q9Y581	213 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	REV3L	O60673	3130 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	TRANK1	O15050	2925 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	DCX	O43602	365 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	NBN	O60934	754 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	CXCL10	P02778	98 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	SKI	P12755	728 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	DGKD	Q16760	1214 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	SESTD1	Q86VW0	696 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	LGR5	O75473	907 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	PTK7	Q13308	1070 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	GPNMB	Q14956	572 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	STXBP2	Q15833	593 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	YME1L1	Q96TA2	773 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	ORC4	O43929	436 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	PDHB	P11177	359 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	NHLH1	Q02575	133 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP1	Q07960	439 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	RBL2	Q08999	1139 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	EML3	Q32P44	896 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	KAT2B	Q92831	832 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	SAMD11	Q96NU1	681 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SKAP2-209	ENST00000497511	EMSY	Q7Z589	1322 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SKAP2-209	ENST00000497511	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		12.64	□□□□□ -0.39

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