RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494136.1

LAMTOR4-212, Transcript of late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 4, humanhuman

TSL 2

Gene LAMTOR4, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR4-212ENST00000494136 RIT2Q99578 217 aa9.57□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 PHF20Q9BVI0 1012 aa9.57□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 TEKT3Q9BXF9 490 aa9.57□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 MSRAQ9UJ68 235 aa9.57□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa9.57□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 COL1A2P08123 1366 aa9.57□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 RSPH10B2B2RC85 870 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 MARCH6O60337 910 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 RSPH10BP0C881 870 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 DNAJB2P25686 324 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 MCM2P49736 904 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 EPHB4P54760 987 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 GRIK4Q16099 956 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 CNKSR3Q6P9H4 555 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 NEK8Q86SG6 692 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 NECAB1Q8N987 351 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 RDM1Q8NG50 284 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 RNPEPQ9H4A4 650 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 ZNF302Q9NR11 478 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 SETD4Q9NVD3 440 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 KCNJ14Q9UNX9 436 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 CEP131Q9UPN4 1083 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 ARID2Q68CP9 1835 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 TET1Q8NFU7 2136 aa9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 EVPLQ92817 2033 aa9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 PTPRSQ13332 1948 aa9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 POTEB3A0JP26 581 aa9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 KIF28PB7ZC32 967 aa9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 TREHO43280 583 aa9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 HBP1O60381 514 aa9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 LARGE1O95461 756 aa9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 MMP1P03956 469 aa9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 IGBP1P78318 339 aa9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 INF2Q27J81 1249 aa9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 LETM2Q2VYF4 491 aa9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 Q4G0T1 1027 aa9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 ZNF618Q5T7W0 954 aa9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 RASIP1Q5U651 963 aa9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 POTEBQ6S5H4 581 aa9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 CCDC83Q8IWF9 413 aa9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 APBB2Q92870 758 aa9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 AIFM3Q96NN9 605 aa9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 BCAS3Q9H6U6 928 aa9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 CHMP2AO43633 222 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 ATG7O95352 703 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 BAG4O95429 457 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 CTDNEP1O95476 244 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 CCNE2O96020 404 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 CTSHP09668 335 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 INSRRP14616 1297 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 CYP3A7P24462 503 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 IKBKEQ14164 716 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 IER5Q5VY09 327 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 PPP4R3AQ6IN85 833 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 ABHD15Q6UXT9 468 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 MIER3Q7Z3K6 550 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 RPAINQ86UA6 219 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 ATP8B4Q8TF62 1192 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 SEPT8Q92599 483 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 SLC5A5Q92911 643 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 TIFAQ96CG3 184 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 C8orf76Q96K31 380 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 FAM20AQ96MK3 541 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 CTAGE1Q96RT6 745 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 DISC1Q9NRI5 854 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 M0R2N6 131 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 TBX3O15119 743 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 MSH4O15457 936 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 DHX15O43143 795 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 TDP2O95551 362 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 CXCL10P02778 98 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 PLCB4Q15147 1175 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 NPY5RQ15761 445 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
LAMTOR4-212ENST00000494136 ZNF484Q5JVG2 852 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms