RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		20.06	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		20.06	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		20.06	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	PCYT2	Q99447	389 aa		20.06	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	TRPC6	Q9Y210	931 aa		20.06	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	SCN5A	Q14524	2016 aa		20.05	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902		H3BQV1	296 aa		20.05	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	ATG7	O95352	703 aa		20.05	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	PSAP	P07602	524 aa		20.05	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	CSF2RA	P15509	400 aa		20.05	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	PPFIA1	Q13136	1202 aa		20.05	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	HIC1	Q14526	733 aa		20.05	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	20.05	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	20.05	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	MBOAT7	Q96N66	472 aa		20.05	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	20.05	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	ZNF302	Q9NR11	478 aa		20.05	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		20.05	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	WDR64	B1ANS9	1081 aa		20.04	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	TREH	O43280	583 aa		20.04	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	IGBP1	P78318	339 aa		20.04	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	PTK7	Q13308	1070 aa		20.04	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	20.04	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	MCTP1	Q6DN14	999 aa		20.04	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		20.04	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		20.04	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	20.04	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		20.04	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	20.04	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	SCLY	Q96I15	445 aa		20.04	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		20.04	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		20.04	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	DISC1	Q9NRI5	854 aa		20.04	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	NRCAM	Q92823	1304 aa		20.03	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	PSMD10	O75832	226 aa		20.03	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	20.03	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	ACR	P10323	421 aa		20.03	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	GRIK4	Q16099	956 aa		20.03	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		20.03	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	POTED	Q86YR6	584 aa		20.03	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	CAGE1	Q8TC20	777 aa		20.03	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		20.03	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	FAM20A	Q96MK3	541 aa		20.03	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		20.03	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	EVPL	Q92817	2033 aa		20.02	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	20.02	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		20.02	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	POTEB3	A0JP26	581 aa		20.02	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	PITPNM1	O00562	1244 aa		20.02	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	SFN	P31947	248 aa		20.02	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	SLC26A2	P50443	739 aa		20.02	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	JAK3	P52333	1124 aa		20.02	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	EPHB4	P54760	987 aa		20.02	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	PLCB4	Q15147	1175 aa		20.02	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	SHH	Q15465	462 aa		20.02	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	POTEB	Q6S5H4	581 aa		20.02	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		20.02	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	20.02	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		20.02	■□□□□ 0.8
USP19-210	ENST00000465902	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		20.01	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	20.01	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	NEMF	O60524	1076 aa		20.01	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	INSRR	P14616	1297 aa		20.01	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	MCM7	P33993	719 aa		20.01	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	THPO	P40225	353 aa		20.01	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	CUL4A	Q13619	759 aa		20.01	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	CALCRL	Q16602	461 aa		20.01	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		20.01	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	20.01	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		20.01	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	SERINC5	Q86VE9	423 aa		20.01	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		20.01	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		20.01	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		20.01	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		20.01	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	20.01	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		20	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	KIF28P	B7ZC32	967 aa		20	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	TBX3	O15119	743 aa		20	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	IQCF3	P0C7M6	154 aa		20	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	CKB	P12277	381 aa		20	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	SELP	P16109	830 aa		20	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	HOXC8	P31273	242 aa		20	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		20	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	20	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	DEFB123	Q8N688	67 aa		20	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	WNT8B	Q93098	351 aa		20	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	IL23A	Q9NPF7	189 aa		20	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		20	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	WNT7A	O00755	349 aa		19.99	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	HBP1	O60381	514 aa		19.99	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	ZNF174	Q15697	407 aa		19.99	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	HSCB	Q8IWL3	235 aa		19.99	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		19.99	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		19.99	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	HAS1	Q92839	578 aa		19.99	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	19.99	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	19.99	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	19.99	■□□□□ 0.79
USP19-210	ENST00000465902	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	19.99	■□□□□ 0.79

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